More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3276 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 308 aa  630  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  64.33 
 
 		 316 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  62.75 
 
 		 309 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  64.9 
 
 		 313 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  63.25 
 
 		 308 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  63 
 
 		 309 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  63.09 
 
 		 303 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  63.33 
 
 		 328 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  62.33 
 
 		 304 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  64.45 
 
 		 314 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  61.87 
 
 		 304 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  61.72 
 
 		 317 aa  388  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  61.74 
 
 		 312 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  62.58 
 
 		 319 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  60.6 
 
 		 305 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  62.79 
 
 		 314 aa  384  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  59.8 
 
 		 310 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  61.06 
 
 		 308 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  61.74 
 
 		 312 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  62.18 
 
 		 313 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  61.07 
 
 		 312 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  60.93 
 
 		 308 aa  377  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  61.33 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  63.28 
 
 		 331 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  61.33 
 
 		 316 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  60.07 
 
 		 302 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  60.67 
 
 		 316 aa  371  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  56.71 
 
 		 310 aa  366  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  61.51 
 
 		 326 aa  360  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  59.21 
 
 		 308 aa  355  6.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  58.22 
 
 		 308 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  58.55 
 
 		 328 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  58.22 
 
 		 308 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  58.69 
 
 		 308 aa  345  4e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  58.22 
 
 		 309 aa  345  5e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  58.09 
 
 		 308 aa  345  5e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  56.77 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  55.66 
 
 		 311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  55.92 
 
 		 308 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  55.93 
 
 		 305 aa  338  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  55.25 
 
 		 305 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  57.38 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  56.67 
 
 		 311 aa  332  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  56.67 
 
 		 311 aa  332  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  55.59 
 
 		 306 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  55.33 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 302 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  55 
 
 		 300 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  53.49 
 
 		 306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  53.77 
 
 		 304 aa  326  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 		 306 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  54.57 
 
 		 321 aa  325  8.000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 		 306 aa  324  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 		 306 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  51.83 
 
 		 306 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  53.33 
 
 		 306 aa  321  8e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 		 329 aa  318  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  54.33 
 
 		 303 aa  318  5e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  52.33 
 
 		 305 aa  316  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  53.49 
 
 		 304 aa  315  5e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  50.48 
 
 		 311 aa  315  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  51.83 
 
 		 301 aa  315  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  52 
 
 		 303 aa  315  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 		 303 aa  315  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  52.65 
 
 		 307 aa  315  9e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  53.23 
 
 		 309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 303 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 305 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 306 aa  311  5.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 305 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  48.49 
 
 		 307 aa  311  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 305 aa  311  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  51.48 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 309 aa  309  5e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  50.51 
 
 		 303 aa  309  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 		 300 aa  308  5e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  54.2 
 
 		 306 aa  308  6.999999999999999e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 		 309 aa  308  8e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 		 309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 302 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 		 309 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 		 309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 		 309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  51.17 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 303 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  50.34 
 
 		 305 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 		 309 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>