More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3270 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  56.52 
 
 		 256 aa  304  7e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.03 
 
 		 256 aa  294  9e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  49.21 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.2 
 
 		 255 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.22 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.8 
 
 		 255 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.66 
 
 		 256 aa  248  9e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  49.21 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.22 
 
 		 256 aa  244  8e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.2 
 
 		 242 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.61 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  48.4 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.21 
 
 		 282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.8 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  46.88 
 
 		 256 aa  241  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  50.99 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.38 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.38 
 
 		 255 aa  238  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.39 
 
 		 254 aa  238  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.22 
 
 		 242 aa  236  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  44.36 
 
 		 262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.88 
 
 		 256 aa  235  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.1 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.56 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.33 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.03 
 
 		 272 aa  229  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.61 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.53 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.43 
 
 		 260 aa  228  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.8 
 
 		 256 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  46.33 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.64 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  46.64 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.54 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.56 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.61 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  48.67 
 
 		 227 aa  218  7.999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.22 
 
 		 256 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.44 
 
 		 256 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.03 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.65 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  45.23 
 
 		 256 aa  212  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1235  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.9 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0229191  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 		 257 aa  208  9e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.14 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.02 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.63 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.31 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.9 
 
 		 248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.08 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  46.18 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.69 
 
 		 258 aa  198  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.36 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.14 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  45.14 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.35 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  41.54 
 
 		 259 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.8 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.15 
 
 		 259 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.73 
 
 		 259 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.49 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.57 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.55 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.75 
 
 		 259 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  46.75 
 
 		 265 aa  192  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06231  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  41.89 
 
 		 246 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  41.41 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.5 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.53 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.45 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  41.42 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.75 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  42.97 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.91 
 
 		 259 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1989  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.55 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000136825  hitchhiker  0.000132084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.06 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.18 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.24 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.11 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.57 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.85 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.78 
 
 		 250 aa  186  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.11 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.7 
 
 		 257 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.7 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  44.57 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.91 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.96 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.28 
 
 		 279 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.98 
 
 		 279 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.8 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2021  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.38 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360558  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06151  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  38.39 
 
 		 303 aa  178  8e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.117028  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.62 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.83 
 
 		 258 aa  178  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.35 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05851  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  38.39 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.597895  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0559  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.74 
 
 		 246 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.199984  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.67 
 
 		 266 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>