131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3269 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  528  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 246 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  49.57 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  50.43 
 
 		 252 aa  225  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  47.86 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  48.72 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  47.86 
 
 		 259 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  48.72 
 
 		 259 aa  218  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  47.6 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  49.55 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  47.93 
 
 		 254 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  45.85 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  47.14 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  48.21 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  47.66 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  48.87 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  49.32 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  46.82 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  48.85 
 
 		 244 aa  208  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  46.96 
 
 		 258 aa  208  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  47.93 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  45.91 
 
 		 248 aa  205  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  46.33 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  48.85 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  46.36 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  48.08 
 
 		 234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  43.35 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  43.28 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  39.39 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  41.26 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  38.78 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  38.78 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  41.52 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  37.4 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  38.62 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  39.63 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  37.08 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  29.28 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  26.89 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  26.89 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  26.89 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  26.89 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  26.89 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  26.89 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  26.89 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  26.98 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  27.47 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  26.34 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  26.57 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  26.34 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  26.11 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  26.11 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  27.18 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  24.34 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  24.34 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1480  methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00449789  normal  0.133133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  28.14 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  24.83 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  30.37 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  26.59 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  25.86 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  27.97 
 
 		 238 aa  52  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1827  hypothetical protein  41.82 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  31.33 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  26.09 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  35.53 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  28.05 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1974  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 252 aa  49.3  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03212  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002771  SAM-dependent methyltransferase  40 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1053  putative methyltransferase  28.07 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.600444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0910  methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2684  hypothetical protein  28.07 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1107  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  28.05 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  32 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00206  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.46 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00211  hypothetical protein  32.46 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0217  putative methyltransferase  32.46 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00136304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0220  putative methyltransferase  32.46 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.960094  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3452  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.607443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0228  putative methyltransferase  32.46 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0210  putative methyltransferase  32.46 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>