79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3255 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  37.58 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  34.78 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  34.78 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  36.12 
 
 		 327 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  40.99 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  32.78 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  36.28 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  36.73 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  38.35 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  38.83 
 
 		 343 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  36.89 
 
 		 319 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  39.22 
 
 		 317 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  38.07 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  37.85 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  38.74 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  38.35 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  38.74 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  37.16 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  38.29 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  37.37 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  39.81 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  36.65 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  35.23 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  32.11 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  28.92 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  28.18 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  27.76 
 
 		 324 aa  125  8.000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  33.77 
 
 		 339 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  33.2 
 
 		 297 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  32.03 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  34.75 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  32.73 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  31.87 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  31.87 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  32.85 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  32.03 
 
 		 309 aa  99  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  33.05 
 
 		 308 aa  89  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  31.78 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  30.34 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  26.22 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  26.22 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  26.22 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 296 aa  52.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  24.73 
 
 		 312 aa  52.8  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  26.05 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  26.05 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  26.05 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  26.05 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  26.05 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  24.23 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  26.88 
 
 		 351 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  27.94 
 
 		 321 aa  49.3  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  25.31 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  29.91 
 
 		 322 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3722  protein of unknown function DUF214  27.04 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233251  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  27.1 
 
 		 352 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  27.1 
 
 		 352 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  27.1 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  27.1 
 
 		 352 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  27.1 
 
 		 352 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  27.1 
 
 		 352 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  27.1 
 
 		 352 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  27.1 
 
 		 352 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  27.1 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0567  hypothetical protein  25.14 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  28.88 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  23.35 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  32.03 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  25 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0951  cell division protein FtsX  22.76 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  28.86 
 
 		 341 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  28.34 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4326  hypothetical protein  27.66 
 
 		 335 aa  42.7  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  29.3 
 
 		 341 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0277  hypothetical protein  26.96 
 
 		 321 aa  42.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000163126  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3503  hypothetical protein  26.4 
 
 		 321 aa  42.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3978  hypothetical protein  25.62 
 
 		 321 aa  42.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000353238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>