More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3213 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
778 aa  1546  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.56 
 
 
1120 aa  311  3e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.74 
 
 
823 aa  281  4e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
1202 aa  276  1e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.03 
 
 
2213 aa  271  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  7.26448e-07 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
1050 aa  266  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1434  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 
1186 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  34.1 
 
 
1141 aa  265  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.1 
 
 
717 aa  262  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
1121 aa  259  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  7.51372e-06 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 
1611 aa  257  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 
1578 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
798 aa  251  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
600 aa  250  9e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  31.87 
 
 
1119 aa  246  1e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  6.73901e-05 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
1193 aa  246  1e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
617 aa  246  1e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
1193 aa  246  1e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
1433 aa  246  1e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 
1397 aa  243  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
911 aa  243  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 
523 aa  242  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 
1391 aa  241  3e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 
1131 aa  241  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1064 aa  241  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.38 
 
 
1501 aa  240  6e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  34.36 
 
 
1111 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 
1078 aa  239  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 
1426 aa  238  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
773 aa  238  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
844 aa  237  5e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
1374 aa  236  1e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2964  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
647 aa  236  1e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 
1363 aa  235  2e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1704  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 
1168 aa  236  2e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 
1122 aa  235  2e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2249  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 
1143 aa  235  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.673162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
919 aa  234  4e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
1007 aa  233  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
1313 aa  233  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1044 aa  231  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
1118 aa  231  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.17 
 
 
770 aa  231  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 
769 aa  231  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  48.96 
 
 
771 aa  230  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 
1027 aa  230  8e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
1118 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
774 aa  229  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 
764 aa  229  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
1245 aa  229  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
661 aa  229  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.21 
 
 
389 aa  228  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  36.23 
 
 
790 aa  227  5e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  34.82 
 
 
1236 aa  227  5e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
1234 aa  227  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 
775 aa  227  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
1236 aa  226  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
763 aa  226  9e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
784 aa  226  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
1236 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  45.99 
 
 
771 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  46.06 
 
 
470 aa  225  2e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  44 
 
 
573 aa  226  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
1236 aa  226  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
1659 aa  226  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 
772 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 
1369 aa  225  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
1234 aa  225  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  53.02 
 
 
508 aa  224  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  45.64 
 
 
470 aa  224  4e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.22 
 
 
468 aa  224  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  34.67 
 
 
1188 aa  223  9e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
1138 aa  223  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
775 aa  223  1e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  35.2 
 
 
783 aa  223  1e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  35.2 
 
 
783 aa  223  1e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  32.12 
 
 
1626 aa  223  1e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 
865 aa  223  1e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
769 aa  222  2e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
779 aa  221  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
1230 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 
916 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  32.45 
 
 
1317 aa  221  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  46.55 
 
 
288 aa  221  4e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 
377 aa  220  8e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 
1276 aa  220  9e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
456 aa  219  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 
782 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 
1267 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 
502 aa  219  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  42.2 
 
 
774 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
1296 aa  219  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  34.67 
 
 
1200 aa  219  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.38 
 
 
1233 aa  219  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.35 
 
 
704 aa  219  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
513 aa  218  3e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
769 aa  218  3e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
1927 aa  217  6e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 
1236 aa  217  7e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
1069 aa  216  1e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>