45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3208 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3208  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  331  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0010  protein of unknown function DUF29  37.01 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1378  protein of unknown function DUF29  37.59 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1125  hypothetical protein  31.97 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1412  protein of unknown function DUF29  40.95 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.516954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3972  protein of unknown function DUF29  33.57 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2146  protein of unknown function DUF29  29.63 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3691  protein of unknown function DUF29  27.27 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3745  protein of unknown function DUF29  27.52 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.292589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1562  protein of unknown function DUF29  27.27 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.357579 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0144  protein of unknown function DUF29  27.03 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.42277  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3658  protein of unknown function DUF29  34.34 
 
 		 104 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0148  protein of unknown function DUF29  27.03 
 
 		 148 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1408  protein of unknown function DUF29  28.57 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.835091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4036  hypothetical protein  27.54 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2015  protein of unknown function DUF29  26.55 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.298519 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3625  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347461  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4999  hypothetical protein  30.92 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1988  protein of unknown function DUF29  26.79 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2766  hypothetical protein  28.19 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1918  protein of unknown function DUF29  30.69 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0890  protein of unknown function DUF29  26.17 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0014  protein of unknown function DUF29  28 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1506  protein of unknown function DUF29  22.31 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1533  protein of unknown function DUF29  22.31 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1914  hypothetical protein  35.82 
 
 		 68 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0580  hypothetical protein  31.03 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00000165262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0622  protein of unknown function DUF29  36.11 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1710  protein of unknown function DUF29  23.97 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000133374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0013  protein of unknown function DUF29  25.19 
 
 		 135 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1418  protein of unknown function DUF29  25.62 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4913  protein of unknown function DUF29  24.24 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.576904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2565  protein of unknown function DUF29  25 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4927  protein of unknown function DUF29  29.41 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2482  protein of unknown function DUF29  31.73 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0170652 
 
 
-
 
NC_009474  Acry_3636  hypothetical protein  35.29 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3570  hypothetical protein  31.43 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2916  protein of unknown function DUF29  41.07 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5034  hypothetical protein  22.78 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1841  protein of unknown function DUF29  33.77 
 
 		 152 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1384  protein of unknown function DUF29  32.39 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2239  protein of unknown function DUF29  22.38 
 
 		 152 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3727  protein of unknown function DUF29  38.71 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1919  protein of unknown function DUF29  27.37 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.891607 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1894  hypothetical protein  27.22 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>