More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3190 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  100 
 
 
319 aa  641    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2836  aspartate carbamoyltransferase  72.99 
 
 
354 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  73.91 
 
 
311 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.34 
 
 
316 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.66 
 
 
316 aa  443  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.33 
 
 
315 aa  434  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.33 
 
 
315 aa  434  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.33 
 
 
315 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.23 
 
 
334 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.95 
 
 
317 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.38 
 
 
317 aa  430  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.95 
 
 
313 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3070  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.4 
 
 
319 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.87496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2007  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.3 
 
 
362 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.28 
 
 
317 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.2 
 
 
316 aa  425  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.19 
 
 
315 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.92 
 
 
321 aa  427  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2555  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.85 
 
 
319 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3091  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.87 
 
 
316 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559987  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3527  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.62 
 
 
317 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1762  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.61 
 
 
318 aa  414  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2424  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.28 
 
 
317 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2247  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.29 
 
 
317 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.414785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.28 
 
 
317 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285295  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0599  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.98 
 
 
322 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2662  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.23 
 
 
320 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1002  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.23 
 
 
320 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.891139  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0223  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.57 
 
 
320 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40055  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0564  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.98 
 
 
322 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1359  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.74 
 
 
319 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.31 
 
 
322 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.3 
 
 
318 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3902  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.9 
 
 
314 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1299  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.65 
 
 
318 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0235362  hitchhiker  0.00573061 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0839  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.12 
 
 
321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.71 
 
 
335 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0602  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.9 
 
 
316 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0924  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.03 
 
 
344 aa  386  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3061  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.26 
 
 
341 aa  363  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.280506  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  56.54 
 
 
320 aa  361  7.0000000000000005e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.03 
 
 
317 aa  347  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.98 
 
 
323 aa  346  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.89 
 
 
317 aa  346  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  58.88 
 
 
329 aa  346  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.33 
 
 
323 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.33 
 
 
323 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.33 
 
 
323 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.38 
 
 
320 aa  341  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.65 
 
 
346 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2893  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.38 
 
 
320 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.38 
 
 
320 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.503342 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2481  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.24 
 
 
316 aa  338  5e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.66 
 
 
334 aa  339  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57 
 
 
323 aa  338  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  54.46 
 
 
313 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2521  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57 
 
 
343 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0385  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57 
 
 
343 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57 
 
 
343 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677096  hitchhiker  0.0028837 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0867  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57 
 
 
343 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3965  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.54 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.68 
 
 
341 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1581  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.07 
 
 
320 aa  335  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.68 
 
 
343 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0757  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.68 
 
 
343 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3808  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.35 
 
 
341 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.92 
 
 
311 aa  334  9e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1994  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.86 
 
 
343 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3167  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.86 
 
 
343 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0365  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.71 
 
 
324 aa  334  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.68 
 
 
361 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.68 
 
 
361 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.68 
 
 
361 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3109  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.68 
 
 
361 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2749  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.68 
 
 
361 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636253  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1465  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.54 
 
 
343 aa  332  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981882  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1353  aspartate carbamoyltransferase  55.84 
 
 
333 aa  332  7.000000000000001e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2913  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.12 
 
 
336 aa  330  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.92 
 
 
310 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.74 
 
 
320 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0910  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.72 
 
 
320 aa  329  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.59 
 
 
310 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56 
 
 
328 aa  328  6e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.25 
 
 
313 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3698  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.07 
 
 
319 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3890  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.72 
 
 
319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3959  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.43 
 
 
320 aa  326  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1380  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.08 
 
 
320 aa  326  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.93 
 
 
311 aa  325  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4614  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.41 
 
 
320 aa  325  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3345  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.43 
 
 
320 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  54.67 
 
 
309 aa  322  4e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.74 
 
 
323 aa  322  4e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.816603  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.97 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.52 
 
 
336 aa  319  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0397  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.98 
 
 
335 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  54.81 
 
 
326 aa  318  9e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.92 
 
 
328 aa  318  9e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  53.8 
 
 
312 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.79 
 
 
310 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>