More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3077 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  100 
 
 		 249 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  76.71 
 
 		 249 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0737  electron transfer flavoprotein beta-subunit  78.31 
 
 		 267 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0122378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  77.51 
 
 		 249 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2550  electron transfer flavoprotein subunit beta  77.91 
 
 		 249 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0793  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  77.91 
 
 		 249 aa  387  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  0.477243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  77.51 
 
 		 249 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  77.91 
 
 		 249 aa  387  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  77.11 
 
 		 249 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0762  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  75.9 
 
 		 249 aa  384  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  76.71 
 
 		 249 aa  384  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  77.11 
 
 		 249 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  75.9 
 
 		 249 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0998  electron transfer flavoprotein subunit beta  77.11 
 
 		 249 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5519  electron transfer flavoprotein subunit beta  76.71 
 
 		 249 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0583  electron transfer flavoprotein beta-subunit  77.11 
 
 		 249 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  76.31 
 
 		 249 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  76.71 
 
 		 249 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  77.51 
 
 		 249 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0938  electron transfer flavoprotein beta-subunit  76.71 
 
 		 249 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  77.11 
 
 		 249 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1223  electron transfer flavoprotein beta-subunit  75.1 
 
 		 249 aa  384  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal  0.15593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  76.71 
 
 		 249 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0931  electron transfer flavoprotein, beta subunit  76.71 
 
 		 249 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  76.71 
 
 		 249 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  75.9 
 
 		 249 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  76.71 
 
 		 249 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  76.71 
 
 		 249 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  76.71 
 
 		 249 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  77.11 
 
 		 249 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  76.71 
 
 		 249 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  76.31 
 
 		 249 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  76.71 
 
 		 249 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1957  electron transfer flavoprotein beta-subunit  75.1 
 
 		 249 aa  381  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4166  electron transfer flavoprotein beta-subunit  75.5 
 
 		 249 aa  381  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4829  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  75.5 
 
 		 249 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  77.11 
 
 		 249 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  76.71 
 
 		 249 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  76.31 
 
 		 249 aa  381  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  75.9 
 
 		 249 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  76.71 
 
 		 249 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3374  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  75.9 
 
 		 249 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7298  electron transfer flavoprotein subunit beta  75.9 
 
 		 249 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207608  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  74.3 
 
 		 249 aa  377  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  74.3 
 
 		 249 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1296  putative electron transfer flavoprotein (beta-subunit)  74.7 
 
 		 249 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3598  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  73.49 
 
 		 249 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2390  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  76.31 
 
 		 249 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.424195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  75.9 
 
 		 249 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2540  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  73.9 
 
 		 249 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2093  electron transfer flavoprotein beta-subunit  75.9 
 
 		 249 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  75.1 
 
 		 249 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3143  electron transfer flavoprotein beta-subunit  73.49 
 
 		 249 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  74.7 
 
 		 249 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  74.7 
 
 		 249 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_004310  BR1971  electron transfer flavoprotein, beta subunit  74.39 
 
 		 248 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  74.7 
 
 		 249 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1896  electron transfer flavoprotein, beta subunit  74.39 
 
 		 248 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  72.29 
 
 		 249 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1011  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  73.98 
 
 		 248 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4307  electron transfer flavoprotein beta-subunit  73.9 
 
 		 249 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3781  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.89 
 
 		 249 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2730  electron transfer flavoprotein subunit beta  72.29 
 
 		 249 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1989  Sigma 54 interacting domain protein  71.89 
 
 		 251 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2168  electron transfer flavoprotein beta-subunit  73.09 
 
 		 249 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0160278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1290  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  74.3 
 
 		 249 aa  363  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0308703  normal  0.0442598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  72.69 
 
 		 249 aa  362  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.89 
 
 		 249 aa  360  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2007  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.89 
 
 		 249 aa  359  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0250  electron transfer flavoprotein subunit beta EtfB  74.79 
 
 		 249 aa  359  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2159  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  72.29 
 
 		 249 aa  358  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7804  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  69.88 
 
 		 446 aa  358  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1140  electron transfer flavoprotein subunit beta  71.49 
 
 		 249 aa  351  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6309  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  69.48 
 
 		 249 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3570  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  71.08 
 
 		 249 aa  350  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25860  electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.28 
 
 		 249 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.064795  normal  0.177804 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2532  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.08 
 
 		 249 aa  349  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.944652  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1471  electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.48 
 
 		 249 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00534232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2707  electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.88 
 
 		 249 aa  349  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462646  normal  0.372016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2209  electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.88 
 
 		 249 aa  348  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15180  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  71.08 
 
 		 249 aa  348  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4010  electron transfer flavoprotein beta subunit  71.49 
 
 		 249 aa  346  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5232  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.08 
 
 		 249 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0937638  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0819  electron transfer flavoprotein subunit beta  70.68 
 
 		 249 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.68 
 
 		 249 aa  345  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3033  electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.08 
 
 		 249 aa  345  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14280  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.48 
 
 		 256 aa  345  6e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577888  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3774  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  70.28 
 
 		 249 aa  344  7e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2185  electron transfer flavoprotein, beta subunit  69.88 
 
 		 249 aa  344  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3526  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  70.28 
 
 		 249 aa  344  7e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  69.08 
 
 		 249 aa  344  8e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4117  electron transfer flavoprotein subunit beta  69.88 
 
 		 249 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.838389  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9247  electron transfer flavoprotein beta subunit  70.68 
 
 		 249 aa  342  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0111601  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2556  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.77 
 
 		 253 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4202  electron transfer flavoprotein, beta subunit  69.88 
 
 		 249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1651  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  69.88 
 
 		 249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2174  electron transfer flavoprotein subunit beta  69.48 
 
 		 249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1995  electron transfer flavoprotein subunit beta  69.08 
 
 		 249 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184939  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0178  electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.55 
 
 		 249 aa  342  4e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6870  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  69.08 
 
 		 249 aa  341  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562162  normal  0.410167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>