24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3073 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3073  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 		 239 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0000522612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  38.39 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2804  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.27 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0398  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.68 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0239  hypothetical protein  37.09 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.71 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0091  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.93 
 
 		 262 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2078  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.53 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1069  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.12 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430937 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.46 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1213  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.86 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0707655  hitchhiker  0.00000433977 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.95 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.67 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2014  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.23 
 
 		 281 aa  95.1  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.77 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.68 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.65 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1544  hypothetical protein  30.05 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.66 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1885  membrane-associated phospholipid phosphatase  33.33 
 
 		 329 aa  48.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  25.51 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.63 
 
 		 378 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  29.71 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2570  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.19 
 
 		 209 aa  42.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.501729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>