More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3070 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
158 aa  314  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 
157 aa  184  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  60 
 
 
157 aa  184  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  60.67 
 
 
157 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  56.96 
 
 
171 aa  181  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  60.26 
 
 
157 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  60.26 
 
 
157 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 
181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  53.55 
 
 
159 aa  172  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  52.56 
 
 
161 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  54.3 
 
 
156 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
153 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  45.7 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
156 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 
153 aa  144  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 
152 aa  144  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  45.75 
 
 
156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  45.7 
 
 
152 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  45.7 
 
 
159 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 
154 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  44.87 
 
 
157 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 
177 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
156 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
156 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 
152 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
156 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  42.5 
 
 
162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  42.5 
 
 
162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 
156 aa  138  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  42.5 
 
 
162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  46 
 
 
152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  43.12 
 
 
163 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 
156 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
157 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  43.29 
 
 
165 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  44.12 
 
 
171 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  44.12 
 
 
174 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  44.08 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  43.53 
 
 
174 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  43.53 
 
 
174 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  43.53 
 
 
174 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  42.5 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  43.53 
 
 
174 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  47.02 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
156 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  43.42 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  43.87 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  47.26 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.29 
 
 
159 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
158 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 
174 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
171 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  43.95 
 
 
161 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  42.44 
 
 
218 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 
156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  43.67 
 
 
161 aa  131  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 
155 aa  130  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  44 
 
 
152 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  44 
 
 
152 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  44 
 
 
152 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
155 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
155 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  42.11 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  41.46 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  41.76 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  41.76 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  41.76 
 
 
222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  41.76 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  41.76 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  41.76 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  41.76 
 
 
222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.48 
 
 
163 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 
161 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
153 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  42.48 
 
 
159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
174 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  42.17 
 
 
168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>