More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2898 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  100 
 
 		 314 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  70.49 
 
 		 345 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  67.2 
 
 		 334 aa  438  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  65.91 
 
 		 321 aa  431  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  66.24 
 
 		 314 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  65.02 
 
 		 321 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  65.68 
 
 		 321 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  67.75 
 
 		 321 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  67.21 
 
 		 321 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  66.45 
 
 		 321 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  65.06 
 
 		 361 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  66.88 
 
 		 320 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  64.31 
 
 		 325 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  62.34 
 
 		 326 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  67.11 
 
 		 321 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  63.43 
 
 		 323 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  64.72 
 
 		 314 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  61.98 
 
 		 324 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  65.03 
 
 		 335 aa  411  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  64.38 
 
 		 331 aa  413  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  63.34 
 
 		 317 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  61.94 
 
 		 324 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  62.26 
 
 		 324 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  63.19 
 
 		 322 aa  408  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  64.69 
 
 		 326 aa  408  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  61.61 
 
 		 324 aa  408  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  62.1 
 
 		 324 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  63.34 
 
 		 312 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  64.82 
 
 		 321 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  61.02 
 
 		 324 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  62.38 
 
 		 335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  63.99 
 
 		 325 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  61.46 
 
 		 324 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  63.99 
 
 		 326 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  64.14 
 
 		 332 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  58.6 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  60.9 
 
 		 318 aa  395  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  60.46 
 
 		 313 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  59.62 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  60.32 
 
 		 317 aa  387  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  61.46 
 
 		 324 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  61.46 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0558  thioredoxin-disulfide reductase  60 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  57.62 
 
 		 311 aa  368  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2208  thioredoxin reductase  61.76 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  58.71 
 
 		 316 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  58.71 
 
 		 316 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  60 
 
 		 314 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  58.01 
 
 		 317 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  60 
 
 		 314 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  55.99 
 
 		 311 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  56.29 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0755  thioredoxin reductase  60.71 
 
 		 315 aa  363  3e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  57.69 
 
 		 316 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  56.29 
 
 		 311 aa  361  8e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  57.93 
 
 		 320 aa  361  1e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  57.93 
 
 		 320 aa  361  1e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1450  thioredoxin-disulfide reductase  61.15 
 
 		 324 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  60 
 
 		 317 aa  359  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  56.65 
 
 		 323 aa  359  4e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  57.41 
 
 		 317 aa  359  4e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  57.74 
 
 		 314 aa  359  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  56.65 
 
 		 323 aa  359  4e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  56.96 
 
 		 334 aa  358  5e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  56.96 
 
 		 318 aa  358  6e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  58.71 
 
 		 320 aa  358  8e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  57.37 
 
 		 316 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  58.71 
 
 		 320 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  57.05 
 
 		 316 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  57.42 
 
 		 319 aa  355  7.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  56.72 
 
 		 320 aa  354  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  55.02 
 
 		 311 aa  354  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  55.52 
 
 		 317 aa  354  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  57.64 
 
 		 316 aa  353  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  58.62 
 
 		 318 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28230  thioredoxin-disulfide reductase  58.65 
 
 		 315 aa  352  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.75824  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  54.52 
 
 		 342 aa  352  4e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  54.6 
 
 		 340 aa  352  5e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  57.32 
 
 		 316 aa  352  5e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  58.1 
 
 		 321 aa  351  8.999999999999999e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  58.81 
 
 		 318 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  57.76 
 
 		 321 aa  350  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  58.1 
 
 		 321 aa  351  1e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  58.81 
 
 		 318 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  55.48 
 
 		 319 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  56.73 
 
 		 318 aa  350  3e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  58.33 
 
 		 317 aa  349  3e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  55.45 
 
 		 321 aa  349  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  54.43 
 
 		 319 aa  349  4e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  56.65 
 
 		 319 aa  349  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  56.15 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  56.65 
 
 		 323 aa  348  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  56.78 
 
 		 317 aa  348  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  53.65 
 
 		 340 aa  348  7e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  57.14 
 
 		 333 aa  348  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  57.1 
 
 		 320 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  57.1 
 
 		 320 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  57.1 
 
 		 320 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  57.1 
 
 		 320 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  57.1 
 
 		 320 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>