More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2896 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  336  7e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  68.18 
 
 		 161 aa  220  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  66.88 
 
 		 157 aa  217  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 155 aa  213  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  66.89 
 
 		 158 aa  213  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 166 aa  212  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  68 
 
 		 166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  65.13 
 
 		 166 aa  209  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 166 aa  206  8e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  67.33 
 
 		 166 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  67.33 
 
 		 166 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  67.33 
 
 		 166 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  60 
 
 		 170 aa  186  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  62 
 
 		 168 aa  185  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  57.33 
 
 		 176 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  56.67 
 
 		 160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 158 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  56 
 
 		 159 aa  170  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 180 aa  168  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  57.14 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  53.69 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  53.69 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  51.37 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  51.37 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  50.68 
 
 		 155 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 153 aa  147  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 152 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 152 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 152 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 181 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  46.71 
 
 		 152 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  49.34 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  49.34 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  49.34 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  49.34 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  43.75 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 156 aa  130  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 169 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  39.49 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  39.49 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  39.49 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  39.49 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  37.28 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 202 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>