62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2850 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  221  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3433  putative chemotactic signal-response protein CheL  48.72 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  41.38 
 
 		 114 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  39.02 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  41.03 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0761  hypothetical protein  38.61 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  45.33 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  37.8 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1343  chemotactic signal-response protein CheL  37.5 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  36.36 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  37.66 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  38.89 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  43.42 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  37.14 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5549  hypothetical protein  39.29 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  35.42 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  38.38 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  39.13 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5521  chemotactic signal-response protein CheL  36.92 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  39.13 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  33.8 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0269  hypothetical protein  32.35 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  42.86 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  38.36 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  36.62 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1129  hypothetical protein  41.18 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1034  hypothetical protein  41.18 
 
 		 210 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  37.5 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4183  hypothetical protein  41.18 
 
 		 205 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1697  hypothetical protein  34.02 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.091579 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  28.79 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  34.21 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1157  hypothetical protein  37.93 
 
 		 193 aa  48.9  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  34.38 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3277  flagellar protein FlgJ-like protein  38.24 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0380  hypothetical protein  31 
 
 		 187 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  34.85 
 
 		 183 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1008  flagellar protein, putative  32.99 
 
 		 206 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2336  hypothetical protein  31.17 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0667  hypothetical protein  36.67 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0693  hypothetical protein  38.18 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0776  hypothetical protein  38.18 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0704  hypothetical protein  38.18 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0409683  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  29.49 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6518  hypothetical protein  35.14 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30 
 
 		 332 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0348  hypothetical protein  29 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3363  putative flagellar protein FlgJ  31.82 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0148  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.91 
 
 		 332 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1505  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.77 
 
 		 430 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1334  chemotactic signal-response protein CheL  33.33 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.406333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6363  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 		 327 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2403  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 		 330 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3036  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 		 327 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3062  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.32 
 
 		 330 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3017  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 		 330 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0003  putative chemotactic signal-response protein CheL  33.33 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2927  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.32 
 
 		 330 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  29.11 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2976  flagellar protein FlgJ, putative  30.14 
 
 		 96 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.740729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>