255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2724 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 
237 aa  461  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1326  phospholipase/carboxylesterase  48.47 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2039  phospholipase/carboxylesterase  48.62 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1632  phospholipase/carboxylesterase  47.93 
 
 
224 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2728  phospholipase/carboxylesterase  50 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.56176  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1386  phospholipase/carboxylesterase  50 
 
 
220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167947  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  44.91 
 
 
219 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  40.83 
 
 
221 aa  155  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1688  putative phospholipase / carboxylesterase  45.75 
 
 
223 aa  154  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00377416  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1189  phospholipase/Carboxylesterase  44.29 
 
 
221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2077  phospholipase/carboxylesterase  45.54 
 
 
220 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1965  phospholipase/carboxylesterase  44.24 
 
 
221 aa  148  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  45.41 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1845  phospholipase/Carboxylesterase  44.83 
 
 
224 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4879  phospholipase/carboxylesterase  44.54 
 
 
227 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1900  phospholipase/Carboxylesterase  43.56 
 
 
235 aa  142  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3842  phospholipase/carboxylesterase  44.91 
 
 
236 aa  138  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1006  phospholipase/carboxylesterase family protein  32.6 
 
 
214 aa  137  2e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1494  phospholipase/carboxylesterase  42.53 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.259302  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0446  phospholipase/carboxylesterase  40.37 
 
 
243 aa  132  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.0467521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0432  phospholipase/carboxylesterase  43.78 
 
 
233 aa  128  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5201  phospholipase/carboxylesterase  40.47 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879928  normal  0.366851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3241  phospholipase/carboxylesterase  38.24 
 
 
222 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774909  normal  0.296389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1130  putative hydrolase ypfH  36.5 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5529  phospholipase/Carboxylesterase  35.29 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.748493 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0935  phospholipase/carboxylesterase family protein  31.67 
 
 
213 aa  103  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0181  phospholipase/carboxylesterase  29.86 
 
 
213 aa  96.7  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  35.12 
 
 
205 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5255  phospholipase/Carboxylesterase  33.49 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  28.57 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  27.54 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3173  esterase YpfH  30.14 
 
 
205 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  32.84 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7027  phospholipase/Carboxylesterase  33.49 
 
 
198 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1079  phospholipase/carboxylesterase  33.5 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  33.17 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1077  esterase YpfH  30.28 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.213936  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2979  esterase YpfH  30.28 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  33.17 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2969  esterase YpfH  30 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1158  esterase YpfH  28.91 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.487845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3504  esterase YpfH  29.6 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  32.84 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00152  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  28.05 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  31.13 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0129  phospholipase/carboxylesterase  27.78 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  30.88 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0789  phospholipase/carboxylesterase  32.7 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1907  carboxylesterase  27.08 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000226911  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  29.6 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  28.79 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  29.28 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  29.67 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  29.28 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1203  esterase YpfH  30.66 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176443  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2845  esterase YpfH  30.19 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2604  esterase YpfH  30.66 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3695  esterase YpfH  30.66 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2620  esterase YpfH  30.66 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2753  esterase YpfH  30.66 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2130  carboxylesterase  30.37 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.939077  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02365  predicted hydrolase  30.19 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1196  phospholipase/Carboxylesterase  30.19 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  26.61 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2310  carboxylesterase  27.59 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0300805  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02327  hypothetical protein  30.19 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  29.33 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3258  phospholipase/carboxylesterase  29.21 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  29.28 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2701  carboxylesterase  31.43 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  28.44 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  30.66 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5170  phospholipase/Carboxylesterase  32.47 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  29.79 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  27.94 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1691  serine esterase  32.68 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2670  carboxylesterase  28.3 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000549714  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1759  Carboxylesterase  30.95 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000153879  hitchhiker  0.00754405 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  29.57 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1113  phospholipase/carboxylesterase  34.67 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.668569  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2626  carboxylesterase  31.28 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000180149  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4278  putative carboxylesterase  28.64 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  27.07 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1888  phospholipase/Carboxylesterase  30.88 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1554  esterase YpfH  29.36 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.694816 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  31.55 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1261  carboxylesterase  28.31 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3306  phospholipase/carboxylesterase family protein  28.36 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703144  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  28.1 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0972  phospholipase/carboxylesterase  30.09 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0395  Carboxylesterase  30.33 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0355  phospholipase/Carboxylesterase  27.32 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220103  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3140  phospholipase/carboxylesterase  28.44 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0649605  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0092  phospholipase/Carboxylesterase  22.22 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.898581  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  29.3 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08036  hypothetical protein  24.88 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  31.55 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  30.38 
 
 
222 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  28.04 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  31.21 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>