289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2680 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2680  50S ribosomal protein L29P  100 
 
 
68 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  66.67 
 
 
68 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  66.67 
 
 
68 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  68.42 
 
 
68 aa  82  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  68.42 
 
 
67 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  65.08 
 
 
70 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  58.21 
 
 
68 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  60 
 
 
67 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  59.38 
 
 
66 aa  77.8  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  64.52 
 
 
70 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  64.81 
 
 
92 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  60.94 
 
 
74 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  61.54 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  63.16 
 
 
64 aa  75.5  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  61.54 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  61.02 
 
 
68 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  66.67 
 
 
66 aa  73.6  0.0000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  66.67 
 
 
66 aa  73.6  0.0000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  58.62 
 
 
68 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  65.38 
 
 
71 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1938  50S ribosomal protein L29  57.89 
 
 
68 aa  73.2  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  65.38 
 
 
71 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  65.38 
 
 
71 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  63.46 
 
 
71 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  61.82 
 
 
69 aa  72  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  61.54 
 
 
69 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  61.54 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0572  ribosomal protein L29  63.46 
 
 
70 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  61.54 
 
 
68 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  61.11 
 
 
66 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  55.38 
 
 
66 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 
68 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  55.38 
 
 
66 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  59.62 
 
 
69 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  55.38 
 
 
66 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  56.25 
 
 
67 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2974  50S ribosomal protein L29  63.46 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.997663  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  55.36 
 
 
68 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  56.9 
 
 
66 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  61.54 
 
 
68 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  59.62 
 
 
71 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  55.74 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  59.62 
 
 
71 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  55.17 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  58.62 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  60.34 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  50.77 
 
 
68 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  59.32 
 
 
77 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0441  50S ribosomal protein L29  46.15 
 
 
66 aa  61.6  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0221163  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  53.45 
 
 
71 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  50 
 
 
63 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  54.1 
 
 
83 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  57.41 
 
 
77 aa  60.5  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  58.18 
 
 
69 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  58.18 
 
 
69 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  58.18 
 
 
69 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0502  50S ribosomal protein L29  47.69 
 
 
66 aa  60.1  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00942547  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  55.36 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  53.57 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  50 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  51.67 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  56.9 
 
 
78 aa  59.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  51.72 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  53.7 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  51.72 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  54.39 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  51.72 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0303  ribosomal protein L29  48.08 
 
 
62 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00299137  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  48.39 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  55.36 
 
 
77 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2316  ribosomal protein L29  42.42 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000905483  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  53.7 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  53.57 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  53.57 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0764  50S ribosomal protein L29  51.92 
 
 
61 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000255511  normal  0.10736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  53.57 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2364  ribosomal protein L29  43.55 
 
 
65 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.649847  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3993  ribosomal protein L29  50 
 
 
63 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000756359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3814  ribosomal protein L29  50 
 
 
63 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000290872  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  44.62 
 
 
70 aa  57.8  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0413  ribosomal protein L29  48.28 
 
 
63 aa  57  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0200811  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  59.57 
 
 
68 aa  57.4  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0331  ribosomal protein L29  48.28 
 
 
63 aa  57  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000705173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 
74 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 
74 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 
74 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  65 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04513  50S ribosomal protein L29  53.85 
 
 
61 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00296689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>