More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2662 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  100 
 
 		 491 aa  956    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  51.58 
 
 		 485 aa  438  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  51.24 
 
 		 468 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  52.91 
 
 		 496 aa  425  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  50.56 
 
 		 464 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  49.78 
 
 		 496 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  49.34 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  48.51 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  50.45 
 
 		 467 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  49.89 
 
 		 476 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  48.45 
 
 		 464 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  49.14 
 
 		 488 aa  395  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  46.88 
 
 		 474 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  46.88 
 
 		 474 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  49.89 
 
 		 471 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  49.14 
 
 		 488 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  47.03 
 
 		 476 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  49.24 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  49.44 
 
 		 471 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  47.46 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  49.12 
 
 		 492 aa  385  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  47.22 
 
 		 480 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  45.9 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  48.18 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  49.67 
 
 		 474 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  46.32 
 
 		 461 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  44.87 
 
 		 467 aa  363  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  46.49 
 
 		 465 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  46.32 
 
 		 461 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  43.37 
 
 		 467 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  44.59 
 
 		 467 aa  359  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  44.67 
 
 		 464 aa  342  7e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  46.6 
 
 		 511 aa  309  6.999999999999999e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.05 
 
 		 513 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.29 
 
 		 385 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  42.04 
 
 		 465 aa  294  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  42.03 
 
 		 455 aa  293  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  50 
 
 		 398 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.13 
 
 		 412 aa  290  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  41.44 
 
 		 455 aa  290  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.91 
 
 		 396 aa  290  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  49.7 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  50 
 
 		 403 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  46.65 
 
 		 386 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  47.9 
 
 		 380 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  49.7 
 
 		 404 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  48.91 
 
 		 386 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  41.7 
 
 		 479 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  48.04 
 
 		 402 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  45.33 
 
 		 403 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  48.04 
 
 		 386 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  47.51 
 
 		 383 aa  286  7e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  43.02 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  46.25 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  46.25 
 
 		 389 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  40.88 
 
 		 492 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.58 
 
 		 477 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  47.46 
 
 		 407 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  41.32 
 
 		 477 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  47.16 
 
 		 407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  40.63 
 
 		 501 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  39.65 
 
 		 456 aa  283  7.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  40.13 
 
 		 500 aa  282  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  39.73 
 
 		 474 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  40.05 
 
 		 476 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  40 
 
 		 479 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.73 
 
 		 474 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  37.16 
 
 		 474 aa  280  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  37.16 
 
 		 474 aa  280  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50 
 
 		 398 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  37.16 
 
 		 474 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  37.16 
 
 		 474 aa  280  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  37.16 
 
 		 474 aa  280  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  48.38 
 
 		 386 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  47.16 
 
 		 388 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  37.16 
 
 		 474 aa  280  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  40.44 
 
 		 449 aa  280  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  37.16 
 
 		 474 aa  279  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  47.16 
 
 		 402 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  37.05 
 
 		 461 aa  279  9e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  47.16 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  46.88 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  47.16 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  47.16 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  50.79 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  46.87 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  47.77 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  47.16 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  40.6 
 
 		 450 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  41.11 
 
 		 453 aa  279  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  40 
 
 		 476 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  40.6 
 
 		 450 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.87 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  38.48 
 
 		 455 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  40.6 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.94 
 
 		 408 aa  277  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.87 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  46.54 
 
 		 383 aa  277  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  42.86 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  48.38 
 
 		 386 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>