27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2641 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2641  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  27.69 
 
 
309 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  25.86 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  25.86 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  28.86 
 
 
535 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
596 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
281 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3961  methyltransferase type 11  24.4 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0335646  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2592  Methyltransferase type 11  24.85 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
974 aa  55.1  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1750  hypothetical protein  25 
 
 
204 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2663  hypothetical protein  31.68 
 
 
413 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.236265 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1151  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5334  Methyltransferase type 11  26.02 
 
 
178 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0786  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
364 aa  52  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300568  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0052  hypothetical protein  27.45 
 
 
172 aa  52  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000148856  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  27.15 
 
 
172 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  26.32 
 
 
403 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.33 
 
 
764 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1396  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.84 
 
 
242 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  22.58 
 
 
213 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2813  hypothetical protein  25.81 
 
 
240 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00156648  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  34.78 
 
 
196 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.43 
 
 
291 aa  41.6  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
643 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
284 aa  41.2  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0749  hypothetical protein  25.76 
 
 
173 aa  41.2  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.4749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>