213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2620 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  100 
 
 		 264 aa  521  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  68.03 
 
 		 246 aa  325  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  67.23 
 
 		 252 aa  316  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  63.87 
 
 		 246 aa  295  4e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  62.18 
 
 		 251 aa  285  5.999999999999999e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  58.82 
 
 		 252 aa  255  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  56.72 
 
 		 250 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  54.77 
 
 		 269 aa  248  5e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  52.87 
 
 		 271 aa  248  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  52.87 
 
 		 271 aa  248  6e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  58.47 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  54.01 
 
 		 240 aa  246  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  52.24 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  55.04 
 
 		 257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  54.1 
 
 		 257 aa  241  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  51.87 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  55.42 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  57.92 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  50.81 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  52.94 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  50.21 
 
 		 266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  55.37 
 
 		 367 aa  234  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  56.33 
 
 		 272 aa  231  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  49.59 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  49.59 
 
 		 279 aa  228  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  56.33 
 
 		 252 aa  228  9e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  49.37 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  52.07 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  55.51 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  50 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  50.42 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  50 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  50 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  50 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  50 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  49.59 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  50 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  49.59 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  52.52 
 
 		 247 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  57.14 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  49.59 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  51.68 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  48.78 
 
 		 279 aa  221  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  50.63 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  51.88 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  47.68 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  52.1 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  49.39 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  53.69 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1047  hemolysin A  50.61 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.940085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  56.02 
 
 		 250 aa  214  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  52.87 
 
 		 250 aa  214  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  48.95 
 
 		 272 aa  214  9e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  56.36 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  53.56 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  51.26 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  46.64 
 
 		 264 aa  209  5e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  49.59 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  47.08 
 
 		 278 aa  208  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  51.65 
 
 		 267 aa  208  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  54.21 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  49.59 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  50 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  48.35 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  50.21 
 
 		 242 aa  206  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  52.1 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  49.16 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  49.16 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  46.67 
 
 		 256 aa  205  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  50.2 
 
 		 246 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  51.65 
 
 		 270 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  50.42 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  52.08 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2377  hemolysin A  57.43 
 
 		 250 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  53.28 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3290  hemolysin A  49.8 
 
 		 269 aa  201  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  48.99 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  50.42 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  50.42 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2966  hemolysin A  50.42 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.173623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  50.83 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  46.64 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  46.56 
 
 		 253 aa  200  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  49.58 
 
 		 277 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  51.45 
 
 		 269 aa  198  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  48.79 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  50 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  48.79 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  46.72 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2155  hemolysin A  47.52 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482655  hitchhiker  0.00924028 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  46.89 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  47.26 
 
 		 267 aa  194  9e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  47.37 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4074  hemolysin A  50.2 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198624  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1098  hemolysin A  52.89 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  45.16 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  53.69 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1020  hemolysin A  46.77 
 
 		 246 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2302  hemolysin A  47.76 
 
 		 316 aa  192  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  47.56 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>