132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2613 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1023    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1915  hypothetical protein  41 
 
 		 526 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294472  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0668  hypothetical protein  43.74 
 
 		 544 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5756  hypothetical protein  42.52 
 
 		 518 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2603  hypothetical protein  45.21 
 
 		 542 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0661  aminoglycoside phosphotransferase  42.25 
 
 		 515 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0314986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4047  hypothetical protein  39.92 
 
 		 526 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  42.16 
 
 		 526 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  41.01 
 
 		 547 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2221  hypothetical protein  42.25 
 
 		 520 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  43.03 
 
 		 524 aa  324  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  41.57 
 
 		 521 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  42.86 
 
 		 499 aa  320  5e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4721  hypothetical protein  40.12 
 
 		 519 aa  309  9e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358451  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  40.19 
 
 		 528 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2122  hypothetical protein  42.03 
 
 		 505 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0470  hypothetical protein  41.84 
 
 		 505 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2392  kinase-like protein  41.07 
 
 		 505 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42432  normal  0.238047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6097  hypothetical protein  44.09 
 
 		 509 aa  270  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3997  aminoglycoside phosphotransferase  39.5 
 
 		 489 aa  259  6e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  32.7 
 
 		 504 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  34.22 
 
 		 532 aa  249  6e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  32.56 
 
 		 530 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  32.34 
 
 		 518 aa  243  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  33.89 
 
 		 522 aa  242  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  37.14 
 
 		 513 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  38.67 
 
 		 498 aa  240  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  35.74 
 
 		 526 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  32.24 
 
 		 510 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  38 
 
 		 482 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2058  hypothetical protein  40.93 
 
 		 447 aa  234  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  33.85 
 
 		 527 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  32.98 
 
 		 508 aa  232  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  38.32 
 
 		 535 aa  232  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  31.38 
 
 		 523 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  36.24 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  30.32 
 
 		 513 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  34.17 
 
 		 556 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  34.2 
 
 		 502 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  30.67 
 
 		 513 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  33.88 
 
 		 551 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  32.54 
 
 		 520 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  32.98 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  33.06 
 
 		 533 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  31.19 
 
 		 540 aa  219  7e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  33.33 
 
 		 520 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  34.48 
 
 		 504 aa  216  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  32.91 
 
 		 512 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  35.53 
 
 		 497 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  32.78 
 
 		 518 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  32.99 
 
 		 508 aa  212  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  33.33 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  33.68 
 
 		 533 aa  209  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  36.04 
 
 		 544 aa  208  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  35.86 
 
 		 520 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0148  hypothetical protein  33.54 
 
 		 514 aa  206  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  30.46 
 
 		 520 aa  203  6e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  31.26 
 
 		 520 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  32.44 
 
 		 521 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  30.86 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  33.75 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  34.2 
 
 		 516 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  34.2 
 
 		 516 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  30.89 
 
 		 520 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  32.56 
 
 		 518 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  33.76 
 
 		 520 aa  200  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  32.61 
 
 		 516 aa  200  7e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  35.26 
 
 		 523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  29.25 
 
 		 520 aa  196  7e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  35.26 
 
 		 523 aa  196  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  29.75 
 
 		 516 aa  193  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  30.83 
 
 		 525 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  33.41 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  32.77 
 
 		 517 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  33.27 
 
 		 509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  34.5 
 
 		 518 aa  183  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  32.4 
 
 		 509 aa  182  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  32.98 
 
 		 549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3211  hypothetical protein  35.84 
 
 		 603 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  30.6 
 
 		 527 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13151  hypothetical protein  30.84 
 
 		 556 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.309836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  33.7 
 
 		 579 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2028  hypothetical protein  36.07 
 
 		 600 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1052  hypothetical protein  36.07 
 
 		 600 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1338  hypothetical protein  36.07 
 
 		 600 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2318  hypothetical protein  36.07 
 
 		 600 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469586  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5918  hypothetical protein  33.26 
 
 		 536 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.571754 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1424  hypothetical protein  35.83 
 
 		 569 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46200  hypothetical protein  39.74 
 
 		 336 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3085  hypothetical protein  35.83 
 
 		 603 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6932  hypothetical protein  35.02 
 
 		 523 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  27.04 
 
 		 519 aa  169  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  31.26 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2314  hypothetical protein  35.37 
 
 		 613 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  33.84 
 
 		 518 aa  166  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2984  hypothetical protein  38.69 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3305  hypothetical protein  30.77 
 
 		 537 aa  160  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6183  hypothetical protein  32.53 
 
 		 514 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.433204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  31.28 
 
 		 518 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12036  hypothetical protein  30.63 
 
 		 498 aa  150  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>