More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2504 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 469 aa  964    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.43 
 
 		 456 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  49.77 
 
 		 450 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.76 
 
 		 470 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.74 
 
 		 467 aa  428  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  48.43 
 
 		 450 aa  425  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  47.52 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  47.25 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.96 
 
 		 451 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  46.76 
 
 		 450 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  47.99 
 
 		 449 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  48.99 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  45.41 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  46.22 
 
 		 449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  45.77 
 
 		 449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  46.45 
 
 		 449 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  45.19 
 
 		 450 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  47.83 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  46.22 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.3 
 
 		 490 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.98 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  43.36 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  43.82 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  43.12 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.8 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.86 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  42.27 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  41.82 
 
 		 452 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  42.05 
 
 		 452 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  42.4 
 
 		 451 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.96 
 
 		 458 aa  353  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  40.75 
 
 		 456 aa  353  5e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  42.92 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  41.86 
 
 		 453 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  39.23 
 
 		 451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  38 
 
 		 480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  41.8 
 
 		 510 aa  338  8e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  37.33 
 
 		 463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.11 
 
 		 457 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  40.14 
 
 		 463 aa  335  7.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.95 
 
 		 465 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  38.1 
 
 		 481 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.95 
 
 		 465 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.48 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  38.1 
 
 		 483 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  38.1 
 
 		 483 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  38.1 
 
 		 483 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  38.1 
 
 		 483 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  40.22 
 
 		 494 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  38.1 
 
 		 481 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  37.33 
 
 		 463 aa  332  6e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  39.91 
 
 		 494 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  37.87 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  39.77 
 
 		 453 aa  332  1e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  39.55 
 
 		 489 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  38.14 
 
 		 473 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  39.3 
 
 		 458 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  40.49 
 
 		 461 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  39.08 
 
 		 458 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  38.32 
 
 		 481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  39.08 
 
 		 458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  36.88 
 
 		 472 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  40.13 
 
 		 470 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.33 
 
 		 478 aa  327  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 		 458 aa  326  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  37.82 
 
 		 485 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  38.39 
 
 		 453 aa  326  6e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  38.22 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  38.67 
 
 		 457 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  38.67 
 
 		 457 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  38.67 
 
 		 457 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  38.67 
 
 		 457 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  37.19 
 
 		 468 aa  323  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  38.08 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  38 
 
 		 460 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0233  coproporphyrinogen III oxidase  37.56 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.891625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  37.85 
 
 		 453 aa  322  6e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 457 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.89 
 
 		 465 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  38.44 
 
 		 465 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  36.14 
 
 		 451 aa  320  3e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  39.96 
 
 		 461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  40.18 
 
 		 500 aa  320  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 		 451 aa  319  7.999999999999999e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.28 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  35.68 
 
 		 451 aa  317  2e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  37.33 
 
 		 460 aa  318  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4224  coproporphyrinogen III oxidase  38.22 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.365232  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.56 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  34.96 
 
 		 455 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  35.91 
 
 		 451 aa  317  3e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  36.67 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>