63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2448 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  390  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3500  hypothetical protein  44.04 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  30.46 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  31.12 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  32.11 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  30.39 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  27.04 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  28.89 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  32.96 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  29.79 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  29.79 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  29.79 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  29.79 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  29.79 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  25.52 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  39.04 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  29.65 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  22.56 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  25.81 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  27.17 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  25 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  29.93 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  27.32 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  28.87 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  26.97 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  26.95 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  26.95 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  26.95 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  26.95 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  28.04 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  26.95 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  26.95 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  27.78 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  29.9 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  23.27 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  29.71 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  29.71 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  28.03 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  28.03 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  29.63 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  34.04 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  26.53 
 
 		 253 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  28.43 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  28.57 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  25.25 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  25.91 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  29.41 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  28.65 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  28.89 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  26.97 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  27.46 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  25.37 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  28.99 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  27.75 
 
 		 251 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  26.23 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  32 
 
 		 197 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  27.75 
 
 		 251 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  28.65 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  26.11 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>