More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2433 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  64.08 
 
 		 152 aa  196  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  61.7 
 
 		 150 aa  186  7e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  62.94 
 
 		 146 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  61.27 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  61.81 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  58.5 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  60.71 
 
 		 176 aa  178  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  61.87 
 
 		 151 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  61.03 
 
 		 150 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  64.18 
 
 		 146 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 151 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 193 aa  176  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  61.15 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  62.24 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 		 176 aa  175  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  59.57 
 
 		 148 aa  173  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 148 aa  171  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  61.48 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  56.95 
 
 		 193 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  62.69 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.77 
 
 		 144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  56.29 
 
 		 151 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  56.29 
 
 		 151 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 193 aa  170  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  56.29 
 
 		 151 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  56.29 
 
 		 151 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 193 aa  170  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  64.23 
 
 		 149 aa  170  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 151 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  62.32 
 
 		 150 aa  170  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  61.59 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  60.58 
 
 		 149 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  60.58 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2054  3-dehydroquinate dehydratase  60.71 
 
 		 151 aa  167  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  59.85 
 
 		 149 aa  166  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.04 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  60.15 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 156 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 163 aa  163  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2570  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 151 aa  163  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  60.29 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  60.29 
 
 		 147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 		 146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  53.06 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  56.83 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  61.59 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.22 
 
 		 184 aa  158  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  54.68 
 
 		 145 aa  156  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  59.4 
 
 		 147 aa  156  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 145 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  60.31 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 178 aa  155  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  56.62 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  51.03 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1784  3-dehydroquinate dehydratase  58.9 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.88 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  55.71 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1476  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 		 178 aa  154  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.73 
 
 		 156 aa  153  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  57.93 
 
 		 162 aa  153  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 149 aa  153  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 		 148 aa  153  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  55.97 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  55.15 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 147 aa  151  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  55.97 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  55.97 
 
 		 191 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>