57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2429 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2429  plasmid maintenance system killer  100 
 
 		 94 aa  196  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  42.11 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2525  plasmid maintenance system killer  40.22 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4746  plasmid maintenance system killer  42.39 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1591  plasmid maintenance system killer  39.13 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0593652  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  40.22 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  39.78 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  34.78 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3837  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  39.77 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3084  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0360  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2470  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1143  proteic killer suppression protein  33.33 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0404  proteic killer suppression protein  33.33 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6999  plasmid maintenance system killer  34.04 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0090  plasmid maintenance system killer  35.87 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0088  plasmid maintenance system killer protein  35.87 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.167827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  31.18 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  33.7 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0767  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000720973 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6434  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2830  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2504  plasmid maintenance system killer  32.61 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000281555  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0022  plasmid maintenance system toxin protein HigB  25.53 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00990261  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4041  plasmid maintenance system killer  32.29 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  36.46 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  36.46 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  32.61 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3199  plasmid maintenance system killer  27.96 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2928  plasmid maintenance system killer  27.96 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.133815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2880  plasmid maintenance system killer  27.96 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  27.84 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2778  plasmid maintenance system killer  46.34 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460932  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  27.84 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2763  plasmid maintenance system killer  35.05 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0413  plasmid maintenance system killer  25.81 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2424  plasmid maintenance system killer  46.34 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228875  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0577  plasmid maintenance system killer  46.34 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3936  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1485  plasmid maintenance system killer  43.9 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4499  plasmid maintenance system killer  25.23 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.538782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6219  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2941  plasmid maintenance system killer  26.88 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00442539  hitchhiker  0.00124461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1668  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.856327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2183  plasmid maintenance system killer  31.18 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454111  unclonable  0.000000258126 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0223  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.642238  normal  0.270748 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3764  plasmid maintenance system killer  40 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3186  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0260939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3069  plasmid maintenance system killer  36.84 
 
 		 92 aa  41.2  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42020  hypothetical protein  48.65 
 
 		 51 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03904  plasmid maintenance system killer protein  27.96 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>