More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2420 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2420  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 		 189 aa  377  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993987  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  54.44 
 
 		 174 aa  203  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  53.71 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  55.29 
 
 		 175 aa  185  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  55.29 
 
 		 175 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0045  hexapeptide transferase family protein  51.76 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0961185  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  55.29 
 
 		 175 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  57.62 
 
 		 182 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1929  hexapaptide repeat-containing transferase  50.91 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000963233  hitchhiker  0.00946276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1520  hexapaptide repeat-containing transferase  57.32 
 
 		 175 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000102664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0223  hypothetical protein  49.69 
 
 		 169 aa  169  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453095  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0072  transferase  51.22 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  49.14 
 
 		 177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  50.6 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  50.6 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  49.4 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  46.29 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1498  carbonic anhydrase  49.7 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  48.57 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  48.57 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0254  hexapaptide repeat-containing transferase  40.88 
 
 		 182 aa  162  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.836815  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  48.21 
 
 		 182 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  43.93 
 
 		 184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000362772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0466  hexapeptide transferase family protein  50.6 
 
 		 171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  45.45 
 
 		 180 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0280  hexapaptide repeat-containing transferase  40.33 
 
 		 182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.801626  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  44 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  44.19 
 
 		 182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0041  carbonic anhydrase  43.93 
 
 		 182 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000411727  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  44.19 
 
 		 182 aa  161  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0401  anhydrase family 3 protein  49.12 
 
 		 179 aa  160  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  48.21 
 
 		 180 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  45.45 
 
 		 180 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  44.57 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0041  carbonic anhydrase, family 3  43.93 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508164  unclonable  0.00000000000448586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  47.65 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0228  hexapaptide repeat-containing transferase  40.33 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  45.09 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000373213  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  46.78 
 
 		 180 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0042  carbonic anhydrase  43.35 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000454133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0037  carbonic anhydrase  43.35 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0034  carbonic anhydrase  43.35 
 
 		 182 aa  158  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000602369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  48 
 
 		 179 aa  158  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0042  carbonic anhydrase  43.58 
 
 		 182 aa  158  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  47.62 
 
 		 182 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00032  putative carbonic anhydrase/acetyltransferase  46.47 
 
 		 180 aa  158  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00477036  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  47.62 
 
 		 182 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  47.62 
 
 		 182 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  47.75 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0426  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  46.36 
 
 		 176 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0045  carbonic anhydrase  43.02 
 
 		 182 aa  156  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.0000010839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  47.19 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1604  hexapaptide repeat-containing transferase  43.68 
 
 		 175 aa  157  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1066  hexapeptide transferase family protein  45.78 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0011  acetyltransferase/carbonic anhydrase  44.85 
 
 		 169 aa  156  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  42.86 
 
 		 182 aa  156  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000548613  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  45.98 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0036  carbonic anhydrase  43.35 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906421  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03943  transferase  46.95 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0042  carbonic anhydrase  43.6 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000058127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0033  carbonic anhydrase/acetyltransferase  45.09 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000120925  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0030  anhydrase family 3 protein  46.47 
 
 		 185 aa  154  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1936  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  49.1 
 
 		 177 aa  154  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  46.51 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0085  putative transferase  42.11 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000367586  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0870  transferase  44.51 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  41.48 
 
 		 179 aa  152  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  47.2 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0989  transferase  44.51 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0032  transferase hexapeptide domain-containing protein  43.18 
 
 		 179 aa  151  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0049  carbonic anhydrase  43.6 
 
 		 180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044877  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3658  acetyltransferase/carbonic anhydrase  44.72 
 
 		 175 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0249  acetyltransferase  47.02 
 
 		 177 aa  151  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1122  putative transferase  46.99 
 
 		 179 aa  150  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000279572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  42.37 
 
 		 184 aa  150  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000121267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  47.56 
 
 		 189 aa  150  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  42.37 
 
 		 184 aa  150  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000608739  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  42.37 
 
 		 184 aa  150  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  42.37 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000042792  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3576  hypothetical protein  42.37 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128421  normal  0.244838 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  42.37 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0290  acetyltransferase  46.71 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0175113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3665  hypothetical protein  42.37 
 
 		 256 aa  149  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000398302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  42.37 
 
 		 256 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  47.85 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2432  carbonic anhydrase  45.61 
 
 		 189 aa  148  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3763  hypothetical protein  42.37 
 
 		 293 aa  148  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000274593  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2735  acetyltransferase  52.78 
 
 		 184 aa  148  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0037  carbonic anhydrase  42.05 
 
 		 181 aa  148  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000544891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  42.44 
 
 		 178 aa  147  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2797  carbonic anhydrase  44.25 
 
 		 180 aa  147  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  42.44 
 
 		 179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35304  predicted protein  49.69 
 
 		 175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1678  carbonic anhydrase  45.33 
 
 		 172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  45.88 
 
 		 176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  42.17 
 
 		 171 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0773  hexapaptide repeat-containing transferase  45.83 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0167469  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2116  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  44.85 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3842  transferase  45.35 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0858  hexapaptide repeat-containing transferase  45.91 
 
 		 172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>