20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2416 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2416  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  250  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4439  hypothetical protein  50 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0486  hypothetical protein  51.81 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.240352  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0010  hypothetical protein  41.49 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0011  hypothetical protein  41.49 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.808442  normal  0.0183228 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2640  hypothetical protein  44.78 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7004  hypothetical protein  37.8 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3394  hypothetical protein  37.35 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2709  hypothetical protein  37.35 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1139  hypothetical protein  35 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3623  hypothetical protein  44.83 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2869  hypothetical protein  39.39 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1935  hypothetical protein  30.38 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.795864  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1907  hypothetical protein  33.78 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0497994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4103  hypothetical protein  42.42 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.918286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2432  hypothetical protein  30.12 
 
 		 101 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2917  hypothetical protein  39.68 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.862357  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1958  hypothetical protein  27.59 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377235  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0811  hypothetical protein  35.21 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2980  hypothetical protein  33.77 
 
 		 89 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>