69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2371 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
475 aa  927  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  38.74 
 
 
442 aa  264  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  38.2 
 
 
466 aa  255  2e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  37.01 
 
 
445 aa  252  9e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  38.29 
 
 
474 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 
455 aa  234  2e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  37.2 
 
 
455 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  38.59 
 
 
465 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  36.42 
 
 
471 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  36.87 
 
 
469 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  37.14 
 
 
469 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.14 
 
 
443 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 
445 aa  216  6e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  34.53 
 
 
467 aa  214  3e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  35.19 
 
 
453 aa  213  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  35.71 
 
 
464 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  35.84 
 
 
456 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  36.18 
 
 
444 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  34.64 
 
 
473 aa  206  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  34.75 
 
 
467 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  37.37 
 
 
473 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  36.2 
 
 
462 aa  200  4e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  35.34 
 
 
471 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  33.84 
 
 
466 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  33.84 
 
 
466 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  33.84 
 
 
466 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  33.84 
 
 
466 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  33.84 
 
 
466 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  33.84 
 
 
466 aa  197  4e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  33.84 
 
 
470 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 
478 aa  189  6e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  37.55 
 
 
460 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  39.21 
 
 
468 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  35.54 
 
 
474 aa  187  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  37.47 
 
 
460 aa  184  2e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  37.47 
 
 
460 aa  184  2e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.18 
 
 
883 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  31.96 
 
 
478 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  32.81 
 
 
454 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
485 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  31.92 
 
 
479 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.69 
 
 
481 aa  176  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  31.1 
 
 
499 aa  175  2e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 
480 aa  174  3e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.19 
 
 
453 aa  174  4e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.94 
 
 
455 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  33.62 
 
 
470 aa  164  2e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 
523 aa  163  5e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  35.09 
 
 
1751 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  28.45 
 
 
482 aa  139  8e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  29.57 
 
 
466 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  28.73 
 
 
468 aa  119  8e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  28.07 
 
 
468 aa  119  1e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  24.6 
 
 
506 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  25.27 
 
 
458 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  26.85 
 
 
490 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  34.26 
 
 
477 aa  73.6  7e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0685  hypothetical protein  22.74 
 
 
472 aa  69.7  1e-10  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00218471  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  21.8 
 
 
500 aa  68.9  2e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  21.8 
 
 
500 aa  68.9  2e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  22.06 
 
 
494 aa  68.2  4e-10  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  25.34 
 
 
572 aa  57.8  4e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  26.11 
 
 
633 aa  56.6  9e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
479 aa  55.5  2e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  28.1 
 
 
507 aa  53.9  6e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  46.67 
 
 
239 aa  50.4  6e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  31.03 
 
 
125 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  46 
 
 
61 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  22.94 
 
 
580 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>