194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2354 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  100 
 
 		 543 aa  1071    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  34.98 
 
 		 508 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  34.5 
 
 		 508 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  32.22 
 
 		 519 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  32.78 
 
 		 596 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  33.88 
 
 		 513 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  31.18 
 
 		 508 aa  216  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  36.35 
 
 		 510 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  32.95 
 
 		 511 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  34.41 
 
 		 510 aa  212  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  32.95 
 
 		 511 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  32.18 
 
 		 512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  32.18 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  31.63 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  31.24 
 
 		 505 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  29.42 
 
 		 487 aa  177  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  31.11 
 
 		 494 aa  176  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  33.53 
 
 		 490 aa  163  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  29.07 
 
 		 499 aa  160  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  28.73 
 
 		 504 aa  157  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  26.24 
 
 		 519 aa  151  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  31.52 
 
 		 494 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  29.17 
 
 		 505 aa  143  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  29.45 
 
 		 514 aa  143  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  30.5 
 
 		 540 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  31.47 
 
 		 520 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  31.55 
 
 		 508 aa  136  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  28.73 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  28.73 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  25.36 
 
 		 518 aa  121  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  29.66 
 
 		 505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  31.67 
 
 		 318 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.98 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  33.91 
 
 		 315 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  24.57 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  26.48 
 
 		 494 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  30.96 
 
 		 502 aa  110  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  29.47 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  30.98 
 
 		 518 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  33.94 
 
 		 508 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  33.94 
 
 		 498 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  34.39 
 
 		 503 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  30.39 
 
 		 500 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  31.91 
 
 		 329 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  33.48 
 
 		 508 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  31.68 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  33.94 
 
 		 508 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  30.77 
 
 		 495 aa  104  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  36.63 
 
 		 433 aa  104  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  36.63 
 
 		 433 aa  104  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  32.08 
 
 		 511 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  36.63 
 
 		 433 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  36.63 
 
 		 433 aa  103  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  36.63 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  36.63 
 
 		 433 aa  103  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  36.63 
 
 		 433 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  36.63 
 
 		 433 aa  103  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  32.13 
 
 		 503 aa  103  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1861  adenylate cyclase  24.36 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  29.91 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  32.57 
 
 		 503 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  36.63 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  29.91 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  29.91 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  33.82 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  36.31 
 
 		 445 aa  101  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  30.84 
 
 		 313 aa  101  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  38.46 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  30.79 
 
 		 545 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  33.81 
 
 		 495 aa  100  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  32.11 
 
 		 503 aa  100  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  34.47 
 
 		 433 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  34.65 
 
 		 433 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  35 
 
 		 433 aa  100  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  34.65 
 
 		 433 aa  100  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  34.47 
 
 		 433 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  29.62 
 
 		 543 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  31.75 
 
 		 588 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  32.11 
 
 		 501 aa  99  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  34.05 
 
 		 508 aa  99  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  30.79 
 
 		 310 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  34.74 
 
 		 321 aa  97.8  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  28.67 
 
 		 500 aa  97.4  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  39.66 
 
 		 529 aa  96.7  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  32.59 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  37.59 
 
 		 512 aa  95.9  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  37.24 
 
 		 512 aa  95.5  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  29.17 
 
 		 545 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  36.71 
 
 		 213 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  36.28 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  35.71 
 
 		 286 aa  94.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  36.71 
 
 		 213 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  36.71 
 
 		 213 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  36.71 
 
 		 213 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  36.71 
 
 		 213 aa  94.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  39.88 
 
 		 435 aa  93.2  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  38.14 
 
 		 492 aa  93.2  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  37.5 
 
 		 454 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  36.71 
 
 		 213 aa  89.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  36.71 
 
 		 215 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>