More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2330 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2330  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1139  response regulator receiver  55.08 
 
 
121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03239  Response regulator receiver domain protein (CheY)  60.83 
 
 
122 aa  141  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1007  chemotaxis protein CheY  54.1 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1853  response regulator receiver protein  51.24 
 
 
122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.955028  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  49.59 
 
 
120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  48.76 
 
 
120 aa  124  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  47.93 
 
 
120 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  45.45 
 
 
120 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  45.45 
 
 
120 aa  120  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  45.45 
 
 
121 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  44.63 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  45.45 
 
 
128 aa  114  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  45.45 
 
 
121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  43.44 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  43.9 
 
 
122 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  45.3 
 
 
120 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  43.9 
 
 
122 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  46.28 
 
 
121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  45.45 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  43.8 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  43.8 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  46.72 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  41.32 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  42.62 
 
 
122 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  40.16 
 
 
121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  40.16 
 
 
121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  41.8 
 
 
122 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
120 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  43.59 
 
 
120 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  41.8 
 
 
122 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  42.98 
 
 
121 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  42.15 
 
 
121 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  41.32 
 
 
123 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 
120 aa  104  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  41.46 
 
 
124 aa  103  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
121 aa  102  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  41.41 
 
 
124 aa  103  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  40.5 
 
 
120 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  42.61 
 
 
116 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  40.5 
 
 
122 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  43.33 
 
 
121 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1535  response regulator receiver protein  38.02 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0267991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
122 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  38.66 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 
120 aa  97.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1732  response regulator receiver protein  44.07 
 
 
122 aa  97.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  38.46 
 
 
119 aa  97.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  39.32 
 
 
121 aa  97.1  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  37.19 
 
 
121 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  41.32 
 
 
121 aa  95.9  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  42.86 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  40.83 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  42.5 
 
 
120 aa  94.7  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  40 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  39.67 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  40.83 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  43.33 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  39.17 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3937  chemotaxis protein CheY  42.61 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450944  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2860  chemotaxis response regulator  42.61 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3115  chemotaxis response regulator  42.61 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1683  chemotaxis response regulator  42.61 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.058459  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3796  response regulator receiver protein  41 
 
 
109 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0078  chemotaxis two-component response regulator CheY1  42.61 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4047  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.772934  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3436  chemotaxis response regulator  42.61 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3856  chemotaxis protein CheY  42.61 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119201  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  38.02 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4159  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174794  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  38.84 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  38.84 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  40 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  38.02 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  38.02 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  38.02 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  38.98 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  38.02 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  38.84 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  35.54 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
121 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  38.46 
 
 
121 aa  90.1  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3183  chemotaxis response regulator  40.87 
 
 
126 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
120 aa  88.2  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
120 aa  88.2  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
120 aa  88.6  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
120 aa  88.2  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
120 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  40.83 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3816  response regulator receiver protein  39.34 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0118  response regulator receiver domain-containing protein  39.34 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4831  response regulator receiver protein  33.9 
 
 
121 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3754  response regulator receiver protein  33.9 
 
 
121 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>