25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2298 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2298  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  751    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00541193  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2839  hypothetical protein  62.22 
 
 		 360 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3736  hypothetical protein  58.31 
 
 		 364 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294096  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3469  hypothetical protein  58.31 
 
 		 364 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3351  monosaccharide-transporting ATPase  57.76 
 
 		 364 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.268142 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4489  putative cytoplasmic protein  54.73 
 
 		 355 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6948  hypothetical protein  55.3 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1541  hypothetical protein  54.73 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6288  hypothetical protein  54.73 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.381063 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6904  hypothetical protein  54.18 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4122  DeoX protein  49.85 
 
 		 337 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4017  DeoX  49.56 
 
 		 337 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4001  DeoX  49.27 
 
 		 337 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.281599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4180  DeoX protein  48.97 
 
 		 337 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4072  DeoX  49.27 
 
 		 337 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0751  hypothetical protein  44.28 
 
 		 337 aa  303  5.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1633  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  24.82 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0532  hypothetical protein  26.8 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  24.48 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1603  hypothetical protein  23.02 
 
 		 376 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260795  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0036  hypothetical protein  23.33 
 
 		 402 aa  49.7  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  22.5 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1361  hypothetical protein  27.32 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  25.17 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>