104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2296 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  350  5.9999999999999994e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  59.75 
 
 		 186 aa  193  9e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  59.88 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  48.92 
 
 		 223 aa  158  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  48.9 
 
 		 216 aa  157  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  48.39 
 
 		 223 aa  157  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  49.73 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  50.55 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  49.19 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  46.2 
 
 		 204 aa  147  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  42.27 
 
 		 220 aa  147  9e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  50.26 
 
 		 212 aa  141  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  46.55 
 
 		 208 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  43.59 
 
 		 208 aa  133  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  46.7 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  46.46 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  44.51 
 
 		 210 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  45.96 
 
 		 208 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  45.45 
 
 		 208 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  40.11 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  38.98 
 
 		 223 aa  104  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  39.57 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  37.71 
 
 		 245 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  37.71 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  34.98 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  37.97 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  38.46 
 
 		 216 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  37.97 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  37.76 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  33.17 
 
 		 219 aa  99  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  37.29 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  37.29 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  37.29 
 
 		 246 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  36.55 
 
 		 224 aa  99  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  33.82 
 
 		 222 aa  98.6  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  37.29 
 
 		 227 aa  98.6  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  37.29 
 
 		 221 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  37.29 
 
 		 221 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  34.57 
 
 		 219 aa  97.8  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  38.64 
 
 		 218 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  32.83 
 
 		 236 aa  95.5  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  36.16 
 
 		 221 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  36.72 
 
 		 222 aa  94.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  36.72 
 
 		 222 aa  94.7  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  36.72 
 
 		 222 aa  94.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  36.16 
 
 		 221 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  36.16 
 
 		 221 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  36.72 
 
 		 221 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  36.72 
 
 		 221 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  36.72 
 
 		 221 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  36.72 
 
 		 221 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  36.72 
 
 		 221 aa  94.4  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  36.72 
 
 		 221 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  35.59 
 
 		 221 aa  94.4  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  36.93 
 
 		 222 aa  93.6  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  36 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  35.48 
 
 		 219 aa  92.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  33.99 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  34.9 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  33.99 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  33.99 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  33.99 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  36.57 
 
 		 225 aa  93.2  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  35.59 
 
 		 223 aa  92.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  34.38 
 
 		 219 aa  92  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  34.38 
 
 		 217 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  34.38 
 
 		 217 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  33.99 
 
 		 226 aa  91.7  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  34.38 
 
 		 217 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  35.88 
 
 		 225 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  36.47 
 
 		 225 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  32.45 
 
 		 221 aa  89.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  34.41 
 
 		 223 aa  89.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  26.25 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  27.48 
 
 		 234 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1276  hypothetical protein  29.71 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0147934  normal  0.415736 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  27.48 
 
 		 234 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  27.48 
 
 		 234 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  31.2 
 
 		 262 aa  48.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  25.78 
 
 		 185 aa  47.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  31.07 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  29.93 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  25.6 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  29.27 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  26.35 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  26.35 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1276  hypothetical protein  30.08 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  31.3 
 
 		 257 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  25.66 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  27.34 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  26.03 
 
 		 266 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15690  hypothetical protein  27.82 
 
 		 254 aa  43.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1013  hypothetical protein  31.45 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1467  hypothetical protein  30.83 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  26.77 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  28 
 
 		 249 aa  42.4  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0523  hypothetical protein  35.44 
 
 		 179 aa  42  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251176 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  29.13 
 
 		 236 aa  42  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  25 
 
 		 219 aa  41.6  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  24.53 
 
 		 285 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>