More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2271 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 
110 aa  223  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  53.33 
 
 
106 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  53.33 
 
 
106 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.38 
 
 
106 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  51.43 
 
 
106 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
107 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.43 
 
 
106 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.57 
 
 
106 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.52 
 
 
106 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  46.23 
 
 
107 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  45.28 
 
 
107 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.67 
 
 
106 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  46.67 
 
 
106 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  45.28 
 
 
107 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
106 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.23 
 
 
122 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.23 
 
 
122 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.23 
 
 
106 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.06 
 
 
106 aa  96.7  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.37 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  44.25 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  43.36 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1760  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  43.27 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000228802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.07 
 
 
124 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.61 
 
 
120 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.28 
 
 
119 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.28 
 
 
119 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1343  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.19 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.37 
 
 
117 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00747  HesB protein family  42.99 
 
 
112 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.521174  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3261  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.75 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  34.86 
 
 
117 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4805  hesB/yadR/yfhF family protein  34.86 
 
 
130 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4646  hypothetical protein  34.86 
 
 
130 aa  87.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  34.86 
 
 
117 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  34.86 
 
 
117 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5044  hesB/yadR/yfhF family protein  34.86 
 
 
117 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  40 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2733  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.19 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1045  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
110 aa  87  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3121  HesB/YadR/YfhF  40.95 
 
 
120 aa  87  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5073  hesB/yadR/yfhF family protein  34.86 
 
 
130 aa  87  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  40.95 
 
 
107 aa  87  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.74 
 
 
121 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.32 
 
 
121 aa  87  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0167  hesB/yadR/yfhF family protein  34.86 
 
 
117 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
108 aa  86.7  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16270  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
119 aa  86.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.591813  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3536  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0677815  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4666  hypothetical protein  33.94 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.94 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1797  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.654159  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.86 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3258  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0083346  hitchhiker  0.0000911572 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.74 
 
 
114 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
206 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1425  iron-binding protein IscA  42.45 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14110  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
118 aa  85.5  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1955  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000220764 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  39.62 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2084  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  39.42 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2142  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.569237  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2218  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0238312  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
122 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1456  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0753774  normal  0.435352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.61 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3155  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.25 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2665  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.05 
 
 
117 aa  84.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840353  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.31 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  39.42 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.38 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1847  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  38.46 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.726204  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2594  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  38.46 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1741  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  38.46 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.46 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0466  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0234938  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.95 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
107 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
120 aa  84.3  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>