More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2191 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 605 aa  1233    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  49.92 
 
 		 591 aa  567  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  49.83 
 
 		 605 aa  561  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  49.16 
 
 		 601 aa  554  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 		 610 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  38.84 
 
 		 607 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  38.26 
 
 		 610 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 610 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  38.93 
 
 		 610 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  37.13 
 
 		 610 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  39.69 
 
 		 609 aa  392  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 603 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 		 603 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 603 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 		 633 aa  351  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 		 592 aa  349  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  38.5 
 
 		 580 aa  346  7e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  37.79 
 
 		 580 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 		 605 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.96 
 
 		 599 aa  337  3.9999999999999995e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 		 604 aa  333  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 602 aa  333  8e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  35.71 
 
 		 592 aa  332  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 604 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 604 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 		 604 aa  330  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 		 599 aa  327  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 607 aa  325  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 598 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 605 aa  321  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 601 aa  320  5e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 592 aa  320  5e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  31.32 
 
 		 587 aa  320  6e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 		 599 aa  317  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 599 aa  317  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 596 aa  317  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 		 606 aa  316  7e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 		 637 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 623 aa  315  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  32.98 
 
 		 652 aa  314  3.9999999999999997e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 617 aa  314  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 633 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 		 612 aa  313  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 608 aa  312  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 		 606 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 596 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 600 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 597 aa  311  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 		 632 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 599 aa  310  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 620 aa  309  8e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 615 aa  309  9e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 612 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 607 aa  309  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 606 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 616 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.73 
 
 		 606 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 607 aa  308  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34 
 
 		 602 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.57 
 
 		 598 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  36.16 
 
 		 630 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 602 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 602 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 669 aa  305  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 616 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  34.1 
 
 		 602 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 599 aa  305  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 598 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 602 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 		 590 aa  303  5.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 		 612 aa  303  7.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 590 aa  303  8.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.37 
 
 		 601 aa  302  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.05 
 
 		 602 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 606 aa  300  4e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 605 aa  300  5e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 		 601 aa  299  8e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.44 
 
 		 597 aa  299  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 594 aa  299  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  35.9 
 
 		 597 aa  298  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 649 aa  298  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 		 610 aa  297  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 672 aa  296  6e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 602 aa  296  8e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 612 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 601 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 613 aa  294  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 		 592 aa  293  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 		 606 aa  292  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 660 aa  292  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 600 aa  292  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 		 593 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 604 aa  291  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  33.28 
 
 		 611 aa  291  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 622 aa  290  4e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 		 603 aa  290  4e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 		 602 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 663 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 		 626 aa  290  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>