More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1925 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
488 aa  949    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  45.93 
 
 
485 aa  331  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.97 
 
 
472 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  44.21 
 
 
510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  44.49 
 
 
471 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  45.02 
 
 
496 aa  307  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 
490 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  40.63 
 
 
492 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
475 aa  294  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  40.38 
 
 
511 aa  289  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
477 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
507 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
513 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  38.98 
 
 
521 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  39.29 
 
 
507 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
507 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
507 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
504 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  39.66 
 
 
507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 
502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 
502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  40.08 
 
 
502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.21 
 
 
485 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.48 
 
 
515 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  41.11 
 
 
509 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  39.71 
 
 
503 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 
504 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  37.37 
 
 
499 aa  282  9e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
506 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
506 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
509 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.2 
 
 
497 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  40.82 
 
 
481 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.85 
 
 
501 aa  281  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 
569 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.8 
 
 
488 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.16 
 
 
488 aa  279  6e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
494 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
494 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.12 
 
 
503 aa  279  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
494 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.49 
 
 
485 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  38.28 
 
 
509 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  40.81 
 
 
494 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
506 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  40.77 
 
 
495 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
506 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.77 
 
 
500 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
506 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
503 aa  277  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  40.92 
 
 
480 aa  276  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
506 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.83 
 
 
490 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 
501 aa  276  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 
501 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
502 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.18 
 
 
497 aa  276  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  44.31 
 
 
491 aa  276  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  39.04 
 
 
502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  37.53 
 
 
501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
473 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  34.03 
 
 
485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  36.99 
 
 
523 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
490 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
485 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  36.19 
 
 
488 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  37.42 
 
 
508 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  40.12 
 
 
476 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.24 
 
 
485 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
493 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  37.87 
 
 
489 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
484 aa  270  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.68 
 
 
465 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
501 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
562 aa  269  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 
496 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.94 
 
 
504 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  40.99 
 
 
493 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  41.2 
 
 
570 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
485 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.91 
 
 
507 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  41.2 
 
 
493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  38.46 
 
 
561 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
546 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
564 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
564 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 
501 aa  267  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.73 
 
 
501 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  38.85 
 
 
508 aa  266  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  37.37 
 
 
520 aa  266  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.06 
 
 
486 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3680  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.78 
 
 
510 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.23 
 
 
495 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  44.42 
 
 
488 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  39.03 
 
 
495 aa  265  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
492 aa  264  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
517 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
487 aa  264  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>