More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1868 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  100 
 
 		 460 aa  929    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  31.29 
 
 		 459 aa  206  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  31.8 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  38.52 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  42.01 
 
 		 413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  40.25 
 
 		 455 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  30.04 
 
 		 443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  48.35 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  38.82 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  30.69 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  34.92 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  38.55 
 
 		 456 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  38.15 
 
 		 445 aa  160  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  44.9 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  48.6 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  36.14 
 
 		 454 aa  156  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  28.82 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  28.82 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  35.08 
 
 		 384 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  39.22 
 
 		 430 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  35.74 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  38.7 
 
 		 387 aa  146  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  48.28 
 
 		 450 aa  146  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  29.17 
 
 		 440 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  55.47 
 
 		 334 aa  143  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  43.9 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  29.01 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  48.98 
 
 		 414 aa  140  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  36.32 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  32.58 
 
 		 392 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  43.5 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  46.59 
 
 		 442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  45.78 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  44.52 
 
 		 309 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  45.78 
 
 		 305 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  45.78 
 
 		 305 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  43.62 
 
 		 229 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  51.28 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  46.39 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  34.65 
 
 		 300 aa  130  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  45.59 
 
 		 238 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  53.45 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  36.21 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  47.01 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  35.77 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  36.97 
 
 		 321 aa  127  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  42.33 
 
 		 310 aa  127  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  34.57 
 
 		 340 aa  127  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  46.09 
 
 		 379 aa  126  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  41.62 
 
 		 288 aa  126  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  32.17 
 
 		 305 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  48.46 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  44.35 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  40.23 
 
 		 300 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  48.31 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  51.97 
 
 		 243 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  51.72 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  35.38 
 
 		 321 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  40.78 
 
 		 233 aa  124  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  44.22 
 
 		 313 aa  123  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  42.95 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  38.57 
 
 		 288 aa  123  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  53.1 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  49.57 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  45.8 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  51.18 
 
 		 238 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  51.18 
 
 		 238 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  40.26 
 
 		 299 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  49.61 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  46.09 
 
 		 303 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  34.11 
 
 		 319 aa  120  7e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  44.35 
 
 		 375 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  44.35 
 
 		 377 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  31.91 
 
 		 292 aa  119  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  46.34 
 
 		 372 aa  119  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  43.51 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  29.62 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  45.21 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  52.14 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  34.11 
 
 		 369 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  44.92 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  39.46 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  42.39 
 
 		 328 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  38.42 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  43.31 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  52.99 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  50.41 
 
 		 440 aa  117  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  50.41 
 
 		 440 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  47.41 
 
 		 300 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  50.41 
 
 		 440 aa  117  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  50.41 
 
 		 440 aa  117  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  50.41 
 
 		 440 aa  117  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  47.41 
 
 		 431 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  50.41 
 
 		 440 aa  117  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  50.41 
 
 		 440 aa  117  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  50.41 
 
 		 440 aa  117  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  46.55 
 
 		 305 aa  117  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  50.41 
 
 		 419 aa  117  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  47.41 
 
 		 441 aa  117  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  47.69 
 
 		 402 aa  117  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>