101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1811 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 282 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  55.68 
 
 		 278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  45.45 
 
 		 320 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  43.59 
 
 		 296 aa  234  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  44.32 
 
 		 285 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  44.32 
 
 		 285 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  43.07 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  42.91 
 
 		 305 aa  232  7.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  42.59 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  42.7 
 
 		 308 aa  228  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  41.45 
 
 		 308 aa  224  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  40.15 
 
 		 276 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  40.89 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  39.42 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  41.26 
 
 		 276 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  39.78 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  37.09 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  37.23 
 
 		 284 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  36.63 
 
 		 304 aa  198  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  38.66 
 
 		 276 aa  198  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  38.63 
 
 		 349 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  38.63 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  41.09 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  34.87 
 
 		 333 aa  175  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  36.7 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  40.14 
 
 		 603 aa  165  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  34.22 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  36.33 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  33.22 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  39.5 
 
 		 607 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  35.46 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  33.21 
 
 		 301 aa  149  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  33.9 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  30.65 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  31.7 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  34.88 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  32.71 
 
 		 299 aa  132  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  27.18 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  33.07 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  36.25 
 
 		 320 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  27.41 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  36.78 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  32.5 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.59 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  29.46 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  24.81 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  26.1 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.1 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  37.96 
 
 		 314 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  27.7 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  24.18 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  25.12 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  27.43 
 
 		 235 aa  52.8  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  25.49 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  22.78 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  21.31 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  26.49 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4002  beta-lactamase domain-containing protein  23.78 
 
 		 264 aa  48.9  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  29.25 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  25.26 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  24.61 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  24.41 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  27.27 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  22.83 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  23.21 
 
 		 307 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  22.22 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  25.47 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  32.41 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  23.29 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3742  ribonuclease Z  36.71 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689963  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.53 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  22.9 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  34.65 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0696  ribonuclease Z  20.66 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  39.34 
 
 		 248 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  20.72 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  28.05 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  21.69 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  24.48 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  22.29 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1403  ribonuclease Z  30.53 
 
 		 338 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  22.59 
 
 		 259 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 		 239 aa  42.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0563  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 248 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>