299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1765 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  100 
 
 		 143 aa  289  7e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  50 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  43.06 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  55.56 
 
 		 113 aa  116  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  61.8 
 
 		 94 aa  116  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  60.95 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  64.71 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  60.95 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  61.18 
 
 		 105 aa  114  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  61.11 
 
 		 93 aa  113  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  50 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  52.78 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  52.78 
 
 		 113 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  50.46 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  46.96 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  51.82 
 
 		 110 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  60 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  47.46 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  49.53 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  49.53 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  51.16 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  51 
 
 		 104 aa  103  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  51.72 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  56.98 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  59.77 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  47.17 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  52.75 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  48.08 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  58.02 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  55.29 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  49.5 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  49.5 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  50 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  49.5 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  49.5 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  49.5 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  49.5 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  49.5 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  48.57 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  49.51 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  48.57 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  52.44 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  48.96 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  45.71 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  39.37 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  47.57 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  46.08 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  50.54 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  47.57 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  44.83 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  49.44 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  49.44 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  42.48 
 
 		 109 aa  91.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  46.09 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  44.44 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  51.19 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  42.31 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  41.35 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  48.31 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  46.61 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  42.45 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  48.81 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  51.11 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  48.81 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  48.81 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  48.81 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  48.81 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  48.81 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  48.81 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  46.6 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  47.52 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  48.81 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  42.55 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  41.35 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  44.83 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  46.81 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  47.57 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  47.27 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  44.12 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  48.84 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  46.91 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  48.28 
 
 		 94 aa  84.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  38.32 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  36.89 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  46.43 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  49.41 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  45.24 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  47.19 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  46.99 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0070  preprotein translocase subunit YajC  48.1 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  48.28 
 
 		 91 aa  84  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0477  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  51.22 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  47.62 
 
 		 93 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  47.62 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>