More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1760 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  100 
 
 		 227 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  69.7 
 
 		 199 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  65.5 
 
 		 201 aa  274  7e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  65.8 
 
 		 209 aa  268  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  60.1 
 
 		 198 aa  266  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  59.3 
 
 		 199 aa  265  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  56.78 
 
 		 201 aa  263  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  58.79 
 
 		 200 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  63.73 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  62.69 
 
 		 209 aa  258  7e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  61.22 
 
 		 198 aa  257  9e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  61.66 
 
 		 205 aa  256  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  62.12 
 
 		 199 aa  256  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  57.79 
 
 		 200 aa  254  6e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  57.79 
 
 		 200 aa  254  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  57.79 
 
 		 200 aa  254  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  60.5 
 
 		 200 aa  251  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  61.11 
 
 		 192 aa  251  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  56.28 
 
 		 200 aa  250  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  59.16 
 
 		 229 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  60.1 
 
 		 193 aa  249  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  61.11 
 
 		 193 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  60.61 
 
 		 193 aa  248  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  58.08 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  60.1 
 
 		 193 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  56.78 
 
 		 200 aa  246  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  55.61 
 
 		 197 aa  245  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  61.62 
 
 		 194 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6857  Superoxide dismutase  56.06 
 
 		 197 aa  244  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0552512 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  58.88 
 
 		 192 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  58.88 
 
 		 192 aa  241  5e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2067  superoxide dismutase, Fe  57.07 
 
 		 210 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.854961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  58.59 
 
 		 193 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3417  manganese and iron superoxide dismutase  54.04 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0123938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  58.76 
 
 		 198 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  60 
 
 		 194 aa  239  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000440787  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  53.69 
 
 		 206 aa  239  2.9999999999999997e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  57.58 
 
 		 193 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  58.59 
 
 		 193 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  58.25 
 
 		 198 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  58.25 
 
 		 198 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  58.25 
 
 		 198 aa  238  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03014  superoxide dismutase  59 
 
 		 199 aa  238  8e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  58.25 
 
 		 198 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2503  Superoxide dismutase  59.8 
 
 		 194 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000289489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1782  superoxide dismutase  59.8 
 
 		 194 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000439358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1775  superoxide dismutase  59.8 
 
 		 194 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1819  superoxide dismutase  59.8 
 
 		 194 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000821956  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  58.59 
 
 		 193 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  59.09 
 
 		 193 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  59.09 
 
 		 193 aa  236  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  59.09 
 
 		 193 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  59.09 
 
 		 193 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  59.09 
 
 		 193 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  59.09 
 
 		 193 aa  236  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  59.09 
 
 		 193 aa  236  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  59.09 
 
 		 193 aa  236  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  59.09 
 
 		 193 aa  236  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1963  superoxide dismutase  58.79 
 
 		 194 aa  235  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1687  superoxide dismutase  59.3 
 
 		 194 aa  235  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000404322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2180  superoxide dismutase  56.57 
 
 		 194 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.678123  normal  0.116868 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  58.08 
 
 		 193 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  58.88 
 
 		 192 aa  234  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000049091  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002934  superoxide dismutase (Fe)  57.5 
 
 		 194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000374974  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1863  superoxide dismutase  58.38 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.410173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1572  superoxide dismutase  59.3 
 
 		 194 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.113962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1647  superoxide dismutase  59.3 
 
 		 194 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000641638  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1639  manganese and iron superoxide dismutase  59.3 
 
 		 194 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2881  superoxide dismutase, Fe  59.3 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2571  superoxide dismutase  58.38 
 
 		 192 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.489375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  57.58 
 
 		 193 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  57.58 
 
 		 193 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2448  superoxide dismutase  58.79 
 
 		 193 aa  232  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103073  normal  0.0475458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1646  superoxide dismutase  55 
 
 		 199 aa  232  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  56.57 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 193 aa  231  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  56.57 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0913  manganese and iron superoxide dismutase  55.96 
 
 		 201 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 193 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1462  Superoxide dismutase  54.27 
 
 		 201 aa  231  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 221 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1986  Superoxide dismutase  55.28 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 221 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  57.58 
 
 		 192 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0073  Superoxide dismutase  57.58 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0822  superoxide dismutase  53.77 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.600443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 192 aa  228  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  57.07 
 
 		 192 aa  228  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 192 aa  228  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  56.57 
 
 		 221 aa  228  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  57.07 
 
 		 192 aa  228  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 192 aa  228  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3194  Superoxide dismutase  56.57 
 
 		 192 aa  228  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194093  normal  0.452704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1920  superoxide dismutase  57.79 
 
 		 194 aa  228  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00591973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1834  superoxide dismutase  58.29 
 
 		 194 aa  228  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000110112  normal  0.958041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 192 aa  227  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  56.57 
 
 		 192 aa  227  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 192 aa  227  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1163  Superoxide dismutase  53.12 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1931  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 192 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>