More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1719 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  47.43 
 
 		 260 aa  231  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  46.77 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  58.41 
 
 		 133 aa  135  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  57.98 
 
 		 143 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  55.36 
 
 		 141 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  47.76 
 
 		 139 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  45.19 
 
 		 143 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  45.19 
 
 		 143 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  51.89 
 
 		 165 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  45.19 
 
 		 143 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 141 aa  113  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  45.86 
 
 		 143 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  52.68 
 
 		 136 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  50.89 
 
 		 154 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  50.89 
 
 		 154 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  50.89 
 
 		 154 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  50.89 
 
 		 154 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  49.55 
 
 		 149 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  48.21 
 
 		 145 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 		 143 aa  109  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  48.21 
 
 		 142 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  46.43 
 
 		 141 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 120 aa  105  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  47.32 
 
 		 120 aa  105  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  47.32 
 
 		 141 aa  105  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  46.85 
 
 		 132 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  44.96 
 
 		 141 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  44.96 
 
 		 141 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  42.31 
 
 		 142 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  45.05 
 
 		 129 aa  102  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  43.65 
 
 		 135 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 		 131 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  46.36 
 
 		 135 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  46.36 
 
 		 135 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  46.36 
 
 		 135 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  48.65 
 
 		 143 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 		 131 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  45.95 
 
 		 137 aa  99  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 127 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3244  thioesterase superfamily protein  45.13 
 
 		 168 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0288964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 131 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  44.14 
 
 		 136 aa  97.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  42.73 
 
 		 131 aa  97.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 132 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1349  thioesterase superfamily protein  55.45 
 
 		 133 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  43.24 
 
 		 176 aa  96.3  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  41.44 
 
 		 131 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 		 164 aa  92.4  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  39.25 
 
 		 147 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 170 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  42.02 
 
 		 170 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.02 
 
 		 170 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  42.02 
 
 		 170 aa  86.3  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  42.02 
 
 		 170 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.02 
 
 		 170 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.02 
 
 		 170 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.58 
 
 		 168 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.58 
 
 		 168 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1351  LysR, substrate-binding  53.95 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.58 
 
 		 171 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  40.58 
 
 		 171 aa  85.9  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  40.58 
 
 		 171 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.58 
 
 		 168 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.58 
 
 		 168 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  40.98 
 
 		 185 aa  85.9  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.58 
 
 		 168 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.18 
 
 		 170 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.58 
 
 		 168 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  40.34 
 
 		 170 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  40.34 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  36.13 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  40.34 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  41.96 
 
 		 119 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  29.26 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  41.96 
 
 		 120 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0003  thioesterase superfamily protein  25.48 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0806344 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  37.86 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1190  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2617  thioesterase superfamily protein  40.87 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  38.28 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  42 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  35.34 
 
 		 176 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 		 161 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  35.34 
 
 		 176 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  36.59 
 
 		 157 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  39.09 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3071  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>