More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1703 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  100 
 
 		 214 aa  423  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  55.77 
 
 		 209 aa  215  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  56.52 
 
 		 208 aa  207  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  55.02 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  54.01 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  51.9 
 
 		 244 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  49.51 
 
 		 230 aa  188  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  52.15 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  51.46 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  48.33 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  56.87 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  51.43 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  54.36 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  52.43 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  47.69 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  50.48 
 
 		 212 aa  178  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  46.53 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  51.44 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  46.53 
 
 		 226 aa  174  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  48.54 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  52.17 
 
 		 246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  49.47 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  50.98 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  51.21 
 
 		 252 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  50.54 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  46.08 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  44.76 
 
 		 213 aa  168  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  46.5 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  51.61 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  46.8 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  47.8 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  48.34 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  48.33 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  48.31 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  48.54 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  45 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  45 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  49.51 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.35 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  43.88 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  44.06 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  48.33 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  42.71 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  44.61 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  47.37 
 
 		 210 aa  158  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  45.93 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  44.79 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  45.93 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  44.34 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  49.52 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  47.31 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  45.59 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  45.59 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 688 aa  154  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  42.03 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  46.86 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  39.23 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  46.43 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  47.03 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 281 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  47 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  41.83 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 206 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  46.95 
 
 		 233 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  42.65 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 204 aa  151  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  41.55 
 
 		 209 aa  151  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 206 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 206 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 206 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 206 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 206 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  41.5 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  42.18 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  44.65 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1870  thymidylate kinase  47.55 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  44.34 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>