More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1687 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1687  inositol monophosphatase  100 
 
 
272 aa  543  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3122  inositol monophosphatase  41.73 
 
 
276 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.537848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2346  inositol monophosphatase  41.41 
 
 
276 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.960977  normal  0.160347 
 
 
-
 
NC_004310  BR0832  inositol monophosphatase family protein  39.36 
 
 
275 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0825  inositol monophosphatase family protein  38.96 
 
 
275 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1511  inositol monophosphatase  36.84 
 
 
274 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3188  inositol monophosphatase  39.18 
 
 
266 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000102923  hitchhiker  0.0000000006834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3030  inositol monophosphatase  35 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0638536  normal  0.49739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2153  inositol monophosphatase  37.21 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0480  inositol monophosphatase  38.15 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  decreased coverage  0.000552939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1933  inositol monophosphatase family protein  36.12 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1944  inositol monophosphatase  36.82 
 
 
275 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0143243  normal  0.761582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1934  inositol monophosphatase family protein  34.96 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1760  inositol monophosphatase  37.22 
 
 
277 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.538338  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2393  inositol monophosphatase  36.6 
 
 
275 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0440  inositol monophosphatase  40.54 
 
 
270 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000464389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1437  inositol monophosphatase  37.02 
 
 
275 aa  142  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224177  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1331  inositol monophosphatase  38.17 
 
 
264 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  0.102778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0369  inositol monophosphatase  39.85 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3111  inositol monophosphatase  36.22 
 
 
269 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  hitchhiker  0.000300564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1943  inositol monophosphatase  36.5 
 
 
274 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910476  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7112  inositol monophosphatase  38.91 
 
 
273 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0508739  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2152  inositol monophosphatase  36.02 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1995  inositol monophosphatase  37.97 
 
 
269 aa  132  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2683  inositol-phosphate phosphatase  38.22 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169796  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27030  Inositol monophosphatase  33.84 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2434  inositol monophosphatase  35.47 
 
 
268 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0059  inositol monophosphatase  32.81 
 
 
271 aa  118  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1499  inositol monophosphatase  31.03 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270636  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3254  inositol monophosphatase family protein  29.6 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2855  Inositol-phosphate phosphatase  29.6 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0377  inositol monophosphatase  31.86 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4495  Inositol-phosphate phosphatase  31.25 
 
 
293 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1820  inositol monophosphatase  29.73 
 
 
268 aa  85.9  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2706  inositol monophosphatase  31 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0746  inositol-phosphate phosphatase  32.31 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  32.52 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0603  Inositol-phosphate phosphatase  34.43 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3216  inositol-phosphate phosphatase  31.09 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  33.05 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  30.34 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4776  inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.56 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1308  inositol monophosphatase  29.81 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.730975  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  28.46 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  31.73 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  31.73 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0345  Inositol-phosphate phosphatase  31.14 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  31.73 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0416  Inositol-phosphate phosphatase  33.2 
 
 
263 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000198572  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2981  inositol-phosphate phosphatase  33.33 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  31.73 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1838  inositol monophosphatase  29.92 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  29.25 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1510  inositol monophosphatase  30.09 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1378  inositol monophosphatase  29.81 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000032162  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0128  inositol monophosphatase  29.44 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1880  inositol monophosphatase  32.86 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  30.7 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4474  inositol-1(or 4)-monophosphatase  32.07 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1007  Inositol-phosphate phosphatase  30.51 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  31.6 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  30.8 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  31.22 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  28.91 
 
 
267 aa  79  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6775  inositol-1(or 4)-monophosphatase  30.41 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2471  inositol monophosphatase family protein  29.83 
 
 
267 aa  79  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  31.22 
 
 
267 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  31.22 
 
 
267 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  30.14 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0158  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.28 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1189  inositol-phosphate phosphatase  26.43 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000047947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  30.48 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4320  inositol-1(or 4)-monophosphatase  30.25 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1625  Inositol-phosphate phosphatase  31.88 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1167  inositol-phosphate phosphatase  26.43 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000100189  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2388  histidinol-phosphate phosphatase  30.77 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000646571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5380  inositol monophosphatase  34.15 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  29.72 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3950  inositol monophosphatase  28.12 
 
 
570 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.176149  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2169  inositol monophosphatase family protein  33.47 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3711  Inositol-phosphate phosphatase  32 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0935134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1841  inositol monophosphatase  29.44 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0967  Inositol-phosphate phosphatase  30.14 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1604  inositol-phosphate phosphatase  29.35 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.620267  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0841  inositol monophosphatase  33.47 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2138  histidinol-phosphate phosphatase  31.28 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  29.3 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  28.68 
 
 
353 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0945  histidinol-phosphate phosphatase, putative  30.19 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0589084  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0295  inositol monophosphatase  28.5 
 
 
487 aa  77  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24616  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04390  inositol monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase family protein  34 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.441923  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0500  Inositol-phosphate phosphatase  28.69 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3024  Inositol-phosphate phosphatase  33.18 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2950  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  32.3 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0697  inositol monophosphatase  31.76 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000108929  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0636  inositol-phosphate phosphatase  28.29 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000877029  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0694  inositol monophosphatase family protein  25.71 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  31.58 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1173  Inositol-phosphate phosphatase  33.33 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  29.91 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>