180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1655 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 		 148 aa  306  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  37.4 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  39.06 
 
 		 135 aa  87  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  30.82 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  36.36 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  34.43 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  33.87 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  30.71 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  33.86 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 		 871 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  34.15 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  31.25 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  31.97 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  30.47 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  33.08 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1354  GGDEF family protein  31.51 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  31.78 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.71 
 
 		 927 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  33.33 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 		 994 aa  70.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  32.23 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  30.71 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  29.92 
 
 		 529 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 529 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 529 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  30.47 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  29.03 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  31.4 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 529 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 529 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 		 722 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 526 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.71 
 
 		 779 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  31.25 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  28.91 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 		 530 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0841  GGDEF family protein  30.77 
 
 		 372 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  32.06 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  30.65 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0858  hemerythrin-like metal-binding protein  31.82 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  30 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  31.71 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.58 
 
 		 997 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  30.65 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  32.33 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  30.34 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  34.35 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4300  hemerythrin-like metal-binding protein  32.28 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77512  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.83 
 
 		 529 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.51 
 
 		 518 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  29.63 
 
 		 596 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  26.71 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 529 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  29.63 
 
 		 519 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  30.58 
 
 		 667 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  27.34 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.6 
 
 		 963 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 529 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  29.27 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  28.77 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  28.89 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.87 
 
 		 515 aa  62  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.87 
 
 		 515 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.05 
 
 		 926 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0473  hemerythrin-like metal-binding protein  31.82 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  29.27 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  28.57 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0987  hemerythrin-like metal-binding protein  27.21 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 		 1328 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  31.09 
 
 		 722 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1744  metal-binding diguanylate cyclase domain-containing protein  25.87 
 
 		 368 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  28.69 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  29.31 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  34.59 
 
 		 615 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  24.81 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  29.31 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  27.42 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.06 
 
 		 963 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3649  hemerythrin-like, metal-binding  28.67 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.16 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3211  hemerythrin HHE cation binding region  33.86 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  31.62 
 
 		 470 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  29.32 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  32.23 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.67 
 
 		 559 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  34.88 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.88 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  34.88 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  27.07 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  26.36 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  29.08 
 
 		 736 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  27.34 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  29.55 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  29.51 
 
 		 360 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  29.58 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  28.15 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  27.41 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0606  GGDEF family protein  30.14 
 
 		 385 aa  57  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.369805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  30.28 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>