180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1655 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 
148 aa  306  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  1.38474e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  37.4 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  39.06 
 
 
135 aa  87  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  30.82 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  36.36 
 
 
135 aa  82.4  2e-15  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  34.43 
 
 
145 aa  80.1  8e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  33.87 
 
 
133 aa  78.6  3e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  30.71 
 
 
133 aa  77.8  4e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  33.86 
 
 
135 aa  77.8  4e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.49718e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  34.15 
 
 
135 aa  75.5  2e-13  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 
871 aa  75.9  2e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  31.25 
 
 
140 aa  74.7  4e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  31.97 
 
 
158 aa  74.3  5e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  30.47 
 
 
137 aa  74.3  5e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  33.08 
 
 
188 aa  74.3  6e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1354  GGDEF family protein  31.51 
 
 
368 aa  73.2  1e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.71 
 
 
927 aa  72.4  2e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  3.90838e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  31.78 
 
 
132 aa  72  2e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 
994 aa  70.9  5e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  33.33 
 
 
192 aa  70.9  5e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  32.23 
 
 
135 aa  70.9  6e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 
529 aa  68.9  2e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  30.71 
 
 
131 aa  68.9  2e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  29.92 
 
 
529 aa  69.3  2e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 
529 aa  68.9  2e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  30.47 
 
 
131 aa  68.6  2e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.39483e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 
529 aa  68.9  2e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.19782e-09 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 
529 aa  68.9  2e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  29.03 
 
 
187 aa  68.9  2e-11  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  31.4 
 
 
143 aa  68.9  2e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 
722 aa  68.2  4e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 
526 aa  68.2  4e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.71 
 
 
779 aa  67.8  5e-11  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  31.25 
 
 
131 aa  67.8  5e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0841  GGDEF family protein  30.77 
 
 
372 aa  67.4  6e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.14515e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  28.91 
 
 
131 aa  67.4  6e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  32.06 
 
 
132 aa  67.4  6e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 
530 aa  67.4  6e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  30.65 
 
 
199 aa  66.6  1e-10  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.58 
 
 
997 aa  66.2  1e-10  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0858  hemerythrin-like metal-binding protein  31.82 
 
 
144 aa  66.6  1e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  30 
 
 
135 aa  66.2  1e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  30.65 
 
 
199 aa  66.6  1e-10  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  1.33018e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  31.71 
 
 
135 aa  66.2  1e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  32.33 
 
 
131 aa  65.9  2e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.83 
 
 
529 aa  65.9  2e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4300  hemerythrin-like metal-binding protein  32.28 
 
 
134 aa  65.5  2e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.51 
 
 
518 aa  65.9  2e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  34.35 
 
 
209 aa  65.5  2e-10  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  30.34 
 
 
142 aa  65.9  2e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  29.63 
 
 
596 aa  66.2  2e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  26.71 
 
 
157 aa  64.3  5e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 
529 aa  64.3  6e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  29.63 
 
 
519 aa  63.9  7e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  27.34 
 
 
153 aa  63.9  7e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  30.58 
 
 
667 aa  63.9  7e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.6 
 
 
963 aa  63.5  8e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  28.89 
 
 
138 aa  62.8  1e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.54042e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  29.27 
 
 
153 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 
529 aa  63.5  1e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  7.84984e-07 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  28.77 
 
 
183 aa  63.5  1e-09  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.87 
 
 
515 aa  62.4  2e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.05 
 
 
926 aa  62.4  2e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  2.40071e-05  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0473  hemerythrin-like metal-binding protein  31.82 
 
 
134 aa  62.4  2e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.87 
 
 
515 aa  62  2e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  29.27 
 
 
153 aa  62  2e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  28.57 
 
 
143 aa  62  3e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0987  hemerythrin-like metal-binding protein  27.21 
 
 
151 aa  61.6  3e-09  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 
1328 aa  61.6  4e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  31.09 
 
 
722 aa  61.6  4e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1744  metal-binding diguanylate cyclase domain-containing protein  25.87 
 
 
368 aa  61.2  5e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  29.31 
 
 
135 aa  60.8  6e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.32936e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  28.69 
 
 
137 aa  60.8  6e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  34.59 
 
 
615 aa  60.5  7e-09  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  24.81 
 
 
160 aa  60.5  8e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  27.42 
 
 
135 aa  60.1  1e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  29.31 
 
 
135 aa  59.7  1e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.02936e-29 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.06 
 
 
963 aa  60.1  1e-08  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3649  hemerythrin-like, metal-binding  28.67 
 
 
155 aa  58.9  2e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16393  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 
141 aa  58.5  3e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.16 
 
 
155 aa  58.5  3e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  29.32 
 
 
138 aa  58.5  3e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3211  hemerythrin HHE cation binding region  33.86 
 
 
176 aa  58.5  3e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  31.62 
 
 
470 aa  58.9  3e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.67 
 
 
559 aa  57.8  5e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  32.23 
 
 
143 aa  57.8  5e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  34.88 
 
 
133 aa  57.4  6e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.88 
 
 
133 aa  57.8  6e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  34.88 
 
 
133 aa  57.4  6e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  26.36 
 
 
147 aa  57.4  7e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  27.07 
 
 
138 aa  57.4  7e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  27.34 
 
 
134 aa  57  8e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  29.08 
 
 
736 aa  57  8e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  29.55 
 
 
137 aa  57  9e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  29.51 
 
 
360 aa  57  9e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  29.58 
 
 
145 aa  57  9e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  28.15 
 
 
152 aa  56.2  1e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  27.41 
 
 
152 aa  56.2  1e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0606  GGDEF family protein  30.14 
 
 
385 aa  57  1e-07  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.369805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  30.28 
 
 
145 aa  56.6  1e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>