105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1617 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  607  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8246  hypothetical protein  35.92 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6081  hypothetical protein  34.65 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.888166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1366  hypothetical protein  36.32 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3049  hypothetical protein  39.76 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2925  hypothetical protein  33.89 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.153636 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5680  hypothetical protein  34.05 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3803  hypothetical protein  35.32 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3150  hypothetical protein  32.1 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2381  hypothetical protein  33.12 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791141  hitchhiker  0.000966536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  48.08 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  53.19 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.1 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  51.06 
 
 		 88 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  48.94 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  45.76 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  45.1 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  42.59 
 
 		 58 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  44.44 
 
 		 82 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  46.67 
 
 		 95 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7053  hypothetical protein  38.89 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  45.28 
 
 		 73 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  47.17 
 
 		 79 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  37.5 
 
 		 74 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  42.37 
 
 		 68 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  42.86 
 
 		 68 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  47.06 
 
 		 52 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  38.46 
 
 		 94 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  45.28 
 
 		 110 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  45.28 
 
 		 110 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  44.23 
 
 		 78 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  38.46 
 
 		 94 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  36.07 
 
 		 66 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  38.18 
 
 		 63 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  40.82 
 
 		 70 aa  49.7  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  44.9 
 
 		 80 aa  49.3  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  44.9 
 
 		 64 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  38.18 
 
 		 100 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.14 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  43.75 
 
 		 85 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  40.38 
 
 		 76 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  43.64 
 
 		 92 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  37.7 
 
 		 202 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  38.18 
 
 		 82 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  33.96 
 
 		 64 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  38.78 
 
 		 64 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  44.68 
 
 		 81 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  32.73 
 
 		 57 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  37.04 
 
 		 81 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  37.7 
 
 		 71 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  41.18 
 
 		 63 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  36.36 
 
 		 67 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  41.18 
 
 		 110 aa  46.2  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2057  hypothetical protein  46.15 
 
 		 155 aa  46.2  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143553  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  38.78 
 
 		 79 aa  46.2  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  52.78 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  37.74 
 
 		 74 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  34 
 
 		 61 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  42.55 
 
 		 66 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  41.67 
 
 		 55 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  37.74 
 
 		 65 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  42 
 
 		 76 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  43.9 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  34.78 
 
 		 74 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  37.74 
 
 		 84 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  35.29 
 
 		 76 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  43.64 
 
 		 74 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  34.78 
 
 		 74 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  40.82 
 
 		 71 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  35.85 
 
 		 78 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  38.64 
 
 		 106 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  32.14 
 
 		 78 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  36.84 
 
 		 72 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.22 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06026  hypothetical protein  34 
 
 		 59 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  34.55 
 
 		 65 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  34.78 
 
 		 74 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  42 
 
 		 89 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  31.58 
 
 		 78 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  45.65 
 
 		 80 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  36.17 
 
 		 85 aa  43.5  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  44.19 
 
 		 76 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  35.71 
 
 		 60 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  44.19 
 
 		 76 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  38.3 
 
 		 76 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  38.64 
 
 		 144 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  42 
 
 		 87 aa  43.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  43.48 
 
 		 67 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  38.78 
 
 		 78 aa  42.7  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  35.19 
 
 		 68 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  35.19 
 
 		 68 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  43.48 
 
 		 67 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  43.48 
 
 		 67 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  43.48 
 
 		 67 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  35.85 
 
 		 68 aa  42.7  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  43.48 
 
 		 67 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  43.48 
 
 		 67 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  39.13 
 
 		 68 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>