More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1577 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1577  ThiJ/PfpI  100 
 
 		 209 aa  407  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  50.26 
 
 		 212 aa  171  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  44.5 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.5 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.97 
 
 		 245 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  42.16 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.33 
 
 		 231 aa  147  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.65 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.67 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  40.38 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.38 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  38.31 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  41 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.58 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  43.5 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  37.44 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10051  hypothetical protein  43.27 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  40.39 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  40.39 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  40.39 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  40.39 
 
 		 242 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  39.9 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  38.65 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  39.9 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.56 
 
 		 251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  41.33 
 
 		 691 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  39.41 
 
 		 238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  35.98 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  35.98 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  38.1 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.02 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.16 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  38.97 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.9 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  39.49 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  39.9 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.9 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  35.96 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  35.1 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  40 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  37.68 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  38.19 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.22 
 
 		 242 aa  118  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.99 
 
 		 284 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  34.55 
 
 		 326 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  32.51 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.51 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.51 
 
 		 284 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.99 
 
 		 284 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  36.67 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  36.67 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.14 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  34.01 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  34.36 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  34.36 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  35.83 
 
 		 238 aa  111  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.08 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.69 
 
 		 277 aa  108  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.24 
 
 		 262 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.88 
 
 		 276 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  31.77 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  35.75 
 
 		 261 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  36.55 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.89 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  35.6 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  35.26 
 
 		 241 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  40.31 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.58 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.92 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.42 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.92 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  36.92 
 
 		 239 aa  101  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.42 
 
 		 227 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  32.31 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  32.31 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.98 
 
 		 231 aa  99.8  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  34.85 
 
 		 276 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  37.37 
 
 		 285 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 297 aa  99  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  36.45 
 
 		 232 aa  98.2  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  38.14 
 
 		 199 aa  98.2  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  42.78 
 
 		 320 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.95 
 
 		 240 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  39.86 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.08 
 
 		 193 aa  95.1  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 226 aa  94  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.85 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.5 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.46 
 
 		 234 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  39.01 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  38.92 
 
 		 227 aa  92  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.23 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.46 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2559  ThiJ/PfpI  46.09 
 
 		 148 aa  91.3  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1188  transcriptional regulator  46.73 
 
 		 140 aa  89.4  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.671315  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  35.38 
 
 		 239 aa  89  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  32.64 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3395  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.59 
 
 		 218 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3384  ThiJ/PfpI  36.59 
 
 		 218 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>