More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1534 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 
527 aa  994    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.94 
 
 
582 aa  335  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  44.69 
 
 
543 aa  276  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  41.85 
 
 
564 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.39 
 
 
565 aa  273  5.000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  38.28 
 
 
615 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  41.71 
 
 
562 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  36.72 
 
 
608 aa  242  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  37.38 
 
 
470 aa  238  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  34.41 
 
 
627 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  37.7 
 
 
597 aa  233  6e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  40.13 
 
 
626 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.44 
 
 
620 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.46 
 
 
579 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.46 
 
 
636 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.46 
 
 
579 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.46 
 
 
579 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.14 
 
 
587 aa  220  6e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  37.23 
 
 
669 aa  219  7e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  33.66 
 
 
631 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  33.46 
 
 
624 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.66 
 
 
628 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  36.4 
 
 
628 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  33.41 
 
 
614 aa  213  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  34.48 
 
 
613 aa  213  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.53 
 
 
598 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.5 
 
 
593 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.11 
 
 
589 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.11 
 
 
589 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  35.6 
 
 
627 aa  209  9e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.91 
 
 
589 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  37 
 
 
600 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.3 
 
 
593 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.61 
 
 
585 aa  206  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.08 
 
 
589 aa  203  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.26 
 
 
575 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.82 
 
 
591 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  34.01 
 
 
584 aa  197  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  37.01 
 
 
575 aa  192  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  34.43 
 
 
577 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  32.27 
 
 
577 aa  180  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.92 
 
 
591 aa  181  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  34.83 
 
 
461 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  33.42 
 
 
585 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  32.02 
 
 
604 aa  178  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.26 
 
 
580 aa  178  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.15 
 
 
591 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  33.71 
 
 
585 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  31.62 
 
 
629 aa  173  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  34.44 
 
 
456 aa  172  9e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  32.54 
 
 
569 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  31.83 
 
 
402 aa  170  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  33.09 
 
 
464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  33.09 
 
 
464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  32.19 
 
 
606 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  35.75 
 
 
640 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_004310  BR0490  voltage gated chloride channel family protein  32.99 
 
 
596 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.889673  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0191  chloride channel core  33.49 
 
 
635 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66054  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.5 
 
 
591 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  35.82 
 
 
579 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  31.13 
 
 
590 aa  159  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5810  Chloride channel core  33.92 
 
 
606 aa  157  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5245  chloride channel core  34.7 
 
 
606 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  decreased coverage  0.00444672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  31.29 
 
 
602 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2374  Chloride channel core  34.74 
 
 
596 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124913  decreased coverage  0.00191401 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.22 
 
 
594 aa  153  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  31.49 
 
 
574 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2902  Chloride channel core  34.34 
 
 
614 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452389  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  32.2 
 
 
471 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  30.69 
 
 
598 aa  150  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.69 
 
 
526 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1483  Chloride channel core  33.89 
 
 
628 aa  149  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  31.84 
 
 
603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0604  chloride channel core  31.25 
 
 
597 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2779  chloride channel core  35.48 
 
 
649 aa  147  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.674097  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3006  Chloride channel core  36.39 
 
 
614 aa  147  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0264261  normal  0.0792273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  26.86 
 
 
603 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  31.27 
 
 
625 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3994  chloride channel core  34.58 
 
 
643 aa  145  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0550665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2134  Chloride channel core  34.21 
 
 
596 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262546  normal  0.105647 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  30.59 
 
 
602 aa  144  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1257  chloride channel-like  36.39 
 
 
615 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95023  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  26.57 
 
 
613 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  26.57 
 
 
457 aa  140  6e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  32.01 
 
 
593 aa  140  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  38.04 
 
 
586 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  30.75 
 
 
559 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2181  Cl- channel voltage-gated family protein  32.61 
 
 
634 aa  138  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  38.66 
 
 
589 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.14 
 
 
533 aa  137  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  31.91 
 
 
604 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.19 
 
 
606 aa  136  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  31.62 
 
 
595 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  30.2 
 
 
594 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  38.42 
 
 
589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3124  Cl- channel, voltage gated  33.91 
 
 
596 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.02 
 
 
598 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4075  chloride channel core  33.52 
 
 
587 aa  133  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.480414  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  31.93 
 
 
579 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4838  chloride channel, core  34.63 
 
 
584 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>