More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1508 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
548 aa  1073    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  57.99 
 
 
539 aa  579  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  56.45 
 
 
537 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  56.34 
 
 
537 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  52.09 
 
 
545 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  50.84 
 
 
542 aa  501  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.2 
 
 
532 aa  487  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  51.53 
 
 
531 aa  477  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  48.87 
 
 
546 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  43.92 
 
 
700 aa  451  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  44.95 
 
 
798 aa  435  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  44.78 
 
 
668 aa  418  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  46.89 
 
 
602 aa  412  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  45.18 
 
 
516 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  44.15 
 
 
530 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.24 
 
 
640 aa  365  1e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  41.44 
 
 
543 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  41.29 
 
 
519 aa  353  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  42.14 
 
 
518 aa  353  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  42.06 
 
 
519 aa  348  1e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  41.72 
 
 
519 aa  348  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  43.38 
 
 
517 aa  341  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  38.79 
 
 
525 aa  341  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  40.81 
 
 
552 aa  337  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  43.27 
 
 
543 aa  336  7e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.65 
 
 
525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  36.42 
 
 
520 aa  322  9.999999999999999e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  41.08 
 
 
533 aa  321  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_1129  predicted protein  39.82 
 
 
562 aa  320  3.9999999999999996e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  41.86 
 
 
528 aa  316  6e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  41.4 
 
 
534 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 
532 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  38.49 
 
 
566 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  39.63 
 
 
536 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  41.46 
 
 
532 aa  311  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  39.28 
 
 
529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  41.21 
 
 
546 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  39.56 
 
 
524 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 
540 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.02 
 
 
529 aa  286  7e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  39.01 
 
 
525 aa  277  3e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  40.45 
 
 
600 aa  264  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  37.48 
 
 
579 aa  261  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  38.72 
 
 
574 aa  260  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  37.69 
 
 
579 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.78 
 
 
587 aa  257  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.67 
 
 
585 aa  256  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 
583 aa  256  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  39.48 
 
 
573 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  37.99 
 
 
579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  36.72 
 
 
582 aa  253  7e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  36.38 
 
 
582 aa  250  5e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  38.17 
 
 
603 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 
569 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 
556 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 
543 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  37.73 
 
 
568 aa  247  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
554 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.81 
 
 
591 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  35.74 
 
 
557 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 
603 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  38.28 
 
 
639 aa  243  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  37.58 
 
 
557 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  43.73 
 
 
520 aa  242  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 
575 aa  240  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 
581 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.96 
 
 
573 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.96 
 
 
557 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  32.56 
 
 
543 aa  238  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.84 
 
 
557 aa  236  9e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  38.12 
 
 
574 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  38.2 
 
 
582 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.01 
 
 
554 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  37.09 
 
 
585 aa  234  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 
567 aa  233  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 
579 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 
582 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 
579 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 
579 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  36.54 
 
 
559 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  37.52 
 
 
522 aa  230  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  38.55 
 
 
560 aa  230  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  34.96 
 
 
564 aa  230  6e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  37.34 
 
 
576 aa  229  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 
547 aa  229  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 
560 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 
562 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.21 
 
 
605 aa  228  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
567 aa  227  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 
595 aa  226  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  31.88 
 
 
560 aa  226  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.7 
 
 
560 aa  225  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  31.88 
 
 
560 aa  225  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  37.27 
 
 
585 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 
582 aa  225  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.25 
 
 
567 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  30.73 
 
 
560 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  30.73 
 
 
560 aa  224  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  30.73 
 
 
560 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
560 aa  224  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>