More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1467 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  100 
 
 		 402 aa  816    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  58.46 
 
 		 403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  52.84 
 
 		 396 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  52.3 
 
 		 398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  53.23 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  53.23 
 
 		 393 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  51.93 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  52.28 
 
 		 392 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  51.54 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  52.94 
 
 		 398 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  51.65 
 
 		 411 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  51.04 
 
 		 393 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  50.38 
 
 		 400 aa  388  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  48.14 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  52.56 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  49.87 
 
 		 399 aa  378  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  51.16 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  50.88 
 
 		 405 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  49.61 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  51.95 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  51.3 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  49.62 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  53.21 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  51.66 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  48.21 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  48.48 
 
 		 405 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  48.88 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  47.81 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  51.79 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  51.53 
 
 		 401 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  47.69 
 
 		 402 aa  363  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  46.95 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  49.36 
 
 		 400 aa  359  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  48.85 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  49.49 
 
 		 407 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  48.73 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  52.96 
 
 		 402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  52.96 
 
 		 402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  52.19 
 
 		 394 aa  352  5e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  46.72 
 
 		 404 aa  352  5e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  47.26 
 
 		 382 aa  352  5e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  48.46 
 
 		 371 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  47.95 
 
 		 391 aa  348  7e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  49.62 
 
 		 389 aa  348  8e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  49.61 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  48.57 
 
 		 389 aa  346  4e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  48.24 
 
 		 405 aa  345  5e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  49.35 
 
 		 396 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  49.35 
 
 		 396 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  46.6 
 
 		 1305 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  47.94 
 
 		 392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  47.68 
 
 		 392 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  48.85 
 
 		 400 aa  336  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  47.68 
 
 		 392 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  47.42 
 
 		 392 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  47.42 
 
 		 392 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  47.42 
 
 		 392 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  53.11 
 
 		 392 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  46.89 
 
 		 371 aa  329  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  45.09 
 
 		 372 aa  328  8e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  42.97 
 
 		 401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  47.96 
 
 		 1230 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  47.59 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  49.25 
 
 		 1228 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  45.55 
 
 		 397 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  46.31 
 
 		 393 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  46.31 
 
 		 393 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  44.33 
 
 		 399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  46.7 
 
 		 410 aa  319  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  46.91 
 
 		 404 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  48.47 
 
 		 1230 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  43.23 
 
 		 408 aa  315  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  44.25 
 
 		 394 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  43.83 
 
 		 372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  45.94 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  46.61 
 
 		 385 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  44.59 
 
 		 397 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  45.01 
 
 		 416 aa  312  7.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  46.35 
 
 		 391 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  45.66 
 
 		 412 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  43.48 
 
 		 401 aa  310  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  44.95 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  44.16 
 
 		 393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  45.09 
 
 		 402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  42.89 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  46.04 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4208  acetate kinase  46.86 
 
 		 367 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.804808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  44.22 
 
 		 398 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  45.97 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  40.5 
 
 		 398 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  39.21 
 
 		 401 aa  290  4e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  43.69 
 
 		 415 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  41.1 
 
 		 397 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  42.93 
 
 		 425 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  42.93 
 
 		 425 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  42.42 
 
 		 392 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  41.85 
 
 		 396 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  40.81 
 
 		 412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  44.75 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  43.83 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>