More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1402 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  100 
 
 		 179 aa  350  7e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  56 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  56 
 
 		 158 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  51.63 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  44.44 
 
 		 159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  48.34 
 
 		 165 aa  151  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0616  CheW protein  50.64 
 
 		 163 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  49.29 
 
 		 162 aa  148  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  47.92 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  45.68 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  47.4 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  40.82 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  41.45 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  37.33 
 
 		 164 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  38.36 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  36.67 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  43.66 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  37.01 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  39.6 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  38.36 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  38.51 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  37.58 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.19 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  36.55 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  38.61 
 
 		 170 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  37.33 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.67 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  35.09 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3562  CheW protein  39.73 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  36.11 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  37.24 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.03 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  38.71 
 
 		 169 aa  108  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.94 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  33.73 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  34.91 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  32.53 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  33.33 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  40.14 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  35.86 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  40.14 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  33.97 
 
 		 167 aa  102  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5776  CheW protein  40.14 
 
 		 185 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727432  normal  0.120994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4816  CheW protein  40.14 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  37.58 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  33.53 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  34.27 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  33.53 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  38.78 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4315  chemotaxis protein  32.48 
 
 		 175 aa  97.8  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0365627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  36.36 
 
 		 147 aa  97.8  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  31.17 
 
 		 185 aa  97.8  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.73 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  34.93 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.93 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  34.93 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  34.93 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  34.93 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  34.93 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  34.93 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  34.93 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  34.93 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  34.69 
 
 		 164 aa  95.5  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.37 
 
 		 164 aa  95.5  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  33.73 
 
 		 164 aa  94.7  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  32.88 
 
 		 161 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  34.64 
 
 		 192 aa  94  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  34.64 
 
 		 194 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7838  CheW protein  34.53 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  33.33 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  33.8 
 
 		 163 aa  93.2  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  32.43 
 
 		 162 aa  92.8  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  32.39 
 
 		 156 aa  91.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  33.8 
 
 		 163 aa  91.7  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  32.37 
 
 		 156 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  33.1 
 
 		 161 aa  91.3  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  32.87 
 
 		 194 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  39.01 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  35.14 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  34.03 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  33.1 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  33.33 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  32.88 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  32.65 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.88 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  31.21 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  32.39 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  32.88 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  32.88 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4675  CheW protein  34.53 
 
 		 157 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  32.19 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  32.88 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0265  putative CheW protein  31.88 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  33.12 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  32.88 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  32.5 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  31.51 
 
 		 160 aa  89.4  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.65 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  33.12 
 
 		 165 aa  89.4  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  33.12 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>