40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1330 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1330  malonate/sodium symporter MadM subunit  100 
 
 		 257 aa  485  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3290  malonate transporter, MadM subunit  71.78 
 
 		 254 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.864394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1065  malonate/sodium symporter MadM subunit  71.78 
 
 		 254 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5079  malonate transporter, MadM subunit  57.94 
 
 		 254 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0450  malonate/sodium symporter MadM subunit  57.54 
 
 		 254 aa  288  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2446  malonate transporter, MadM subunit  61.75 
 
 		 254 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02640  putative malonate transporter, MadM subunit  60.32 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.519007 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1268  malonate transporter, MadM subunit  59.29 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1240  malonate transporter, MadM subunit  59.29 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761133  normal  0.122304 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1146  malonate transporter, MadM subunit  58.89 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523152  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0787  malonate transporter, MadM subunit  59.29 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5294  malonate/sodium symporter MadM subunit  58.33 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0823289  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1158  malonate transporter, MadM subunit  58.5 
 
 		 255 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0300  malonate transporter subunit MadM  58.89 
 
 		 254 aa  285  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.62285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10360  malonate transporter, MadM subunit  61.11 
 
 		 255 aa  284  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4411  malonate/sodium symporter MadM subunit  58.89 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.676957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3149  malonate transporter, MadM subunit  59.52 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3869  malonate transporter, MadM subunit  59.29 
 
 		 254 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4945  malonate transporter, MadM subunit  59.29 
 
 		 254 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0533752 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2051  malonate transporter, MadM subunit  58.89 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3195  malonate transporter, MadM subunit  58.5 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.585208 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6324  malonate transporter, MadM subunit  56.92 
 
 		 255 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0044  malonate transporter, MadM subunit  59.06 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0292354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2804  malonate transporter, M subunit  58.89 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0953  malonate/sodium symporter MadM subunit  59.14 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6859  malonate transporter, MadM subunit  58.66 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1612  malonate/sodium symporter MadM subunit  59.36 
 
 		 259 aa  275  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1551  malonate transporter, MadM subunit  57.54 
 
 		 252 aa  275  8e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0388918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4284  malonate/sodium symporter MadM subunit  57.71 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0339134  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3038  malonate transporter, M subunit  58.1 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.218243  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0537  malonate transporter, MadM subunit  58.1 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976582  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1450  malonate transporter, MadM subunit  58.1 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.53305  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0616  malonate transporter, MadM subunit  58.1 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1254  malonate transporter, MadM subunit  58.1 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1580  malonate transporter, M subunit  58.1 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2875  signal transduction histidine kinase, LytS  59.2 
 
 		 254 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.369454  normal  0.783252 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1481  malonate transporter, MadM subunit  57.71 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315449  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5375  malonate transporter, MadM subunit  57.31 
 
 		 254 aa  268  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1147  malonate/sodium symporter, MadM subunit  52.78 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.141999  normal  0.564343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0218  putative malonate transporter, MadM subunit  62.86 
 
 		 36 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.826701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>