226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1234 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1234  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 523 aa  1058    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.774717  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  60.12 
 
 		 504 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  61.34 
 
 		 512 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  61.35 
 
 		 504 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  61.11 
 
 		 504 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0905  phosphoglyceromutase  61.35 
 
 		 505 aa  595  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.835251  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  57.28 
 
 		 516 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0379  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 		 504 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  57.65 
 
 		 506 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2757  phosphoglyceromutase  57.54 
 
 		 506 aa  553  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  54.99 
 
 		 511 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  54.99 
 
 		 511 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 		 511 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  54.49 
 
 		 515 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  54.3 
 
 		 515 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 		 513 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2593  phosphoglyceromutase  56.46 
 
 		 506 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.721523  normal  0.885019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0934  phosphoglyceromutase  56.06 
 
 		 506 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  55.8 
 
 		 511 aa  535  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0089  phosphoglyceromutase  57.85 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0359859  normal  0.664593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  54.62 
 
 		 509 aa  532  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  55.42 
 
 		 510 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  53.94 
 
 		 511 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  55.21 
 
 		 511 aa  531  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  53.74 
 
 		 508 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  55.38 
 
 		 519 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  54.03 
 
 		 510 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2506  phosphoglyceromutase  54.64 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  52.73 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  52.84 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  52.84 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  54.1 
 
 		 517 aa  521  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  52.16 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  53.03 
 
 		 514 aa  521  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  52.84 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  53.42 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  52.47 
 
 		 514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  52.47 
 
 		 514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  52.17 
 
 		 514 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  51.19 
 
 		 514 aa  517  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  51.19 
 
 		 514 aa  518  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  52.47 
 
 		 514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  52.47 
 
 		 514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  52.15 
 
 		 514 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  52.47 
 
 		 514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  52.47 
 
 		 514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  52.17 
 
 		 514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  52.47 
 
 		 514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  54.51 
 
 		 510 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  52.27 
 
 		 514 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  52.07 
 
 		 514 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  52.27 
 
 		 529 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 		 514 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  52.07 
 
 		 514 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  51.35 
 
 		 552 aa  513  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  51.97 
 
 		 514 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  51.97 
 
 		 514 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  52.07 
 
 		 514 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  52.27 
 
 		 514 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  52.07 
 
 		 514 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  52.34 
 
 		 514 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  52.25 
 
 		 514 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  51.97 
 
 		 514 aa  510  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  52.06 
 
 		 510 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  51.97 
 
 		 515 aa  508  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  54.83 
 
 		 525 aa  508  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  51.85 
 
 		 512 aa  510  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  51.97 
 
 		 515 aa  509  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 		 510 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  56.64 
 
 		 513 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  52.79 
 
 		 516 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  53.53 
 
 		 513 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  51.97 
 
 		 515 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  51.27 
 
 		 512 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 		 512 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  51.48 
 
 		 514 aa  505  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  49.14 
 
 		 525 aa  502  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  54.69 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  50.48 
 
 		 512 aa  504  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  51.27 
 
 		 511 aa  504  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 		 513 aa  502  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  54.67 
 
 		 510 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  53.68 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 520 aa  500  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  54.21 
 
 		 512 aa  500  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  49.41 
 
 		 517 aa  500  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  51.68 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  53.12 
 
 		 512 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1431  phosphoglyceromutase  50.97 
 
 		 530 aa  498  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  52.55 
 
 		 513 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0526  phosphoglyceromutase  54.62 
 
 		 509 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.594564  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0684  phosphoglyceromutase  54.62 
 
 		 509 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113328 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  52.14 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  52.75 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  51.25 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  55.04 
 
 		 512 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 		 521 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  51.25 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0701  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 552 aa  487  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  52.05 
 
 		 510 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>