More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1176 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 342 aa  681    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  49.12 
 
 		 344 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  49.42 
 
 		 342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  50.43 
 
 		 344 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  48.24 
 
 		 344 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  48.24 
 
 		 347 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  48.25 
 
 		 347 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  47.66 
 
 		 347 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  47.37 
 
 		 347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  52.77 
 
 		 344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  49.56 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  46.8 
 
 		 343 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  53.31 
 
 		 358 aa  321  9.000000000000001e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  51.01 
 
 		 344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  52.74 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  47.35 
 
 		 341 aa  318  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  49.42 
 
 		 346 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  48.55 
 
 		 346 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  47.35 
 
 		 361 aa  315  8e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  50.73 
 
 		 345 aa  309  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  48.38 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  49.86 
 
 		 359 aa  298  9e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  47.13 
 
 		 354 aa  291  8e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  50.46 
 
 		 345 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  49.28 
 
 		 356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  43.82 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  46.29 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  51.38 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  48.41 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  48.56 
 
 		 346 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  44.41 
 
 		 341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  44.38 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  44.67 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  40.46 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  44.28 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  43.77 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  43.77 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  43.77 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  43.77 
 
 		 340 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  43.19 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  45.22 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  42.9 
 
 		 340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  44.74 
 
 		 341 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  43.15 
 
 		 342 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  43.53 
 
 		 342 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  43.73 
 
 		 341 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  45.4 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  45.4 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  40.68 
 
 		 577 aa  245  6.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  45.11 
 
 		 340 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  45.11 
 
 		 340 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  45.11 
 
 		 340 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  45.11 
 
 		 340 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  41.13 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  46.38 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  41.21 
 
 		 368 aa  242  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  44.83 
 
 		 340 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  44.25 
 
 		 340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  44.35 
 
 		 341 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  44.35 
 
 		 341 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  44.35 
 
 		 341 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  44.77 
 
 		 346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  44.48 
 
 		 341 aa  232  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  43.02 
 
 		 353 aa  232  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  44.06 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  44.06 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  42.86 
 
 		 341 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  43.9 
 
 		 340 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  43.9 
 
 		 340 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  39.55 
 
 		 578 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  42.32 
 
 		 340 aa  215  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  35.76 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  36.86 
 
 		 582 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  34.85 
 
 		 407 aa  183  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  36.75 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  43.64 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  42.5 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  36.56 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  38.67 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  34.76 
 
 		 328 aa  146  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  39.21 
 
 		 346 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  42.57 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  33.91 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  40.96 
 
 		 438 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  45.6 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1093  histone deacetylase superfamily protein  37.24 
 
 		 439 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718834  normal  0.264484 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  31.23 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  36.73 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  36.73 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  30.26 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  39.83 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  49.22 
 
 		 342 aa  136  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0024  histone deacetylase superfamily  36.4 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263374 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  39.36 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  41.33 
 
 		 451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  32.31 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  38.17 
 
 		 478 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  38.72 
 
 		 352 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>